导致龟腐皮的原因有很多，必须找到根本原因，对症下药，才能根本解决问题。
龟进入新环境，免疫力下降，出现应激，腐皮者，静养，大部分可自愈
对于腐皮反复复发者，应考虑环境问题。首先考虑水质问题，龟不适应水质时会出现腐皮，当环境水质败坏（如：过久不换水，食物残渣污染水质等）时，龟容易出现腐皮，此外，换水后龟出现腐皮的情况，常常是由于龟不适应新的水质或换水过于频繁，使龟难以适应，应适当进行困水，降低换水频率。
处理完水质问题后，其次考虑温差问题，温差也是腐皮的致病因素之一，尤其是早春与晚秋的早晚温差较大。易出现腐皮，龟苗晒太阳后进入水中所产生的温差，也易使体质差的苗子出现腐皮。水体小而光照时间长，龟缸受光面积大者，由于白天水温升得较高。日温差大，龟也有可能出现腐皮。
龟腐皮时，常常会出现拒水行为，龟在野外出现腐皮时，就是通过离水进行充分干养，防止进一步感染，从而自愈的。
通过对同一群龟进行对比实验发现，使用晒台对让龟得到干燥，在一定程度上具有预防腐皮的作用。
龟出现轻微腐皮时，无须加以干扰，龟通过晒太阳大部分可自愈，对腐皮迟迟不好或更加严重者。最常用也是最基本的方法是消毒干养，例如擦拭碘伏后辅助以金霉素眼膏，干养，一段时间后腐皮即可脱落。

一些自己治腐皮的例子
鳖菌灵治疗腐皮实验。对象是一只四肢与头部溃烂的黄喉拟水龟，时间在早春，将鳖菌灵溶于龟缸水，加温，每日换药，两周后龟腐皮基本脱落，头部新皮肤开始生长，停药，未见复发，1月后四肢皮肤基本长成，使用鳖菌灵应严格控制用量，并且浸泡鳖菌灵时不可阳光直射，否则溶液将变红色。
艾叶治疗腐皮实验，对象是五只全身大面积腐皮的草龟小碌仔和一只8cm亚成母草龟。其颈部被其他龟咬伤致感染。将干艾草一小撮放入盆中装满水，煮沸，放，凉溶液呈微黄色即可，将龟白天正常饲养，晚上浸泡艾叶水，三日后，发现五只草碌仔腐皮基本脱落，亚成母草龟颈部感染好转，转入正常环境，饲养一段时间后新皮生成，恢复健康。
碘伏消毒干养治疗腐皮，对象是一只7cm亚成公草龟，新龟入缸后出现全身腐皮，擦碘伏后，晚上干养，白天照常养，约3~4天后，腐皮脱落，转为正常养。
腐皮自愈，一只自养四年的巴西龟转入新环境时，出现轻微腐皮，通过晒太阳几天后腐皮自愈。
重度腐皮治疗，一直4cm花草杂龟左后腿重度腐皮并溃烂，指甲脱落，最开始用双氧水消毒，涂金霉素眼膏，腐皮未加重，之后加温泡鳖菌灵一段时间后，腐皮脱落，渐渐长出新皮。

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