扁桃体吞咽一侧有异物感，可以服用以下药物进行治疗：
抗生素：如头孢克肟胶囊、头孢地尼等，用于控制感染，减轻炎症。
清热解毒的中成药物：如清热解毒口服液、胆木浸膏糖浆等，有助于清热解毒，缓解扁桃体不适。
局部治疗药物：可用银黄含化片含化，或金喉健局部喷雾，这些药物能直接作用于患处，缓解异物感及疼痛。
注意事项： 在服用上述药物时，务必遵循医嘱，按时按量服用，避免过量或滥用。 如扁桃体一侧过于肥大，表面有角化物、新生物或分泌物等，建议及时就医，可能需要行扁桃体摘除手术。 患者在治疗过程中，应注意饮食清淡，多食用富含维生素的食物，避免辛辣刺激性食物，控制烟酒等刺激性物质的摄入。