人类有23对46条染色体，其中22对44条为常染色体，另外一对为性染色体，XY组合的为男性，XX组合的为女性。Y染色体只能父子相传，所以研究Y染色体，可以发现人群在父系关系上的迁徙和发展。
经研究，全部现代智人Y染色体单倍型类群分为18个类型，用从A到R的十八个字母作为代号。一个男性的Y染色体发生突变，一定会被他的直系男性后裔所继承，非该男性的后代，则不会带有这个突变。而每个男性的一个细胞中，只有一份Y染色体，一份称为单倍体。因此，以单倍体Y染色体上的突变命名的“类群”，就称之为“单倍群”。
简单的说，父系Y染色体单倍群的命名规则是：以D-F15479为例。横杠“-”前的D是单倍群编号，横杠“-”后的F15479是突变名,横杠后的首写字母，则是发现这个突变并命名的单位代码，如F代表复旦大学。“单倍群编号-突变名”构成完整的单倍群名称。首字母必须是大写。首字母后的单倍群编号交替使用数字和英文字母来编号下游的分支。突变名的首字母也必须是大写。