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G病毒样本的数量和来源问题：
G病毒样本原本只有一份，由威廉博士研发。汉克小队的任务是夺取这份G病毒样本。在威廉博士被汉克小队射伤后，他给自己注射了G病毒，变成了怪物。在战斗中，威廉杀死了除汉克以外的所有U.S.S小队成员，并且G病毒样本散落了一地。汉克最后拿走的样本是威廉博士变异后散落的样本之一。至于艾达拿到的样本，根据剧情，艾达在里昂离开后“复活”，并将之前从雪莉的挂链中藏匿的G病毒样本带至市郊的苹果小旅店与威斯克接洽。因此，艾达拿到的样本应该是她之前就藏匿好的，而不是从实验室直接取得的。
汉克在下水道的生存问题：
汉克在下水道中生存了大约一周的时间。在这段时间里，他可能依靠下水道中的水源维持生命，至于食物来源，可能是通过搜寻周围环境或者保护伞公司空投的补给箱来获得。关于汉克如何在下水道中生存一周的具体细节，游戏和相关资料并没有给出详细的解释，这部分可能存在剧情上的模糊处理。

汉克手上本来就有一份。至于汉克在下水道如何存活的，第四幸存者本身是一个额外模式，剧情上就没有什么描写，存在诸多和主线剧情无法衔接的地方，不用在意。
艾达手上的那份，从重制版来看，就是里昂扔下去的那份。其他的，包括雪梨这个活体样本，以及威斯克从威廉尸体上获得的样本。
不过重制版很多剧情为了演出效果，结合了原版表里两个版本的剧情，所以看上去很多不合理。原版里，官方认定的女表男里剧情，艾达在半路捡到了雪梨的挂坠，G病毒样本就在挂坠里；而在男表女里剧情里，艾达从实验室廊桥坠落，这里无论艾达和里昂都没有接触到G病毒样本，G病毒样本一直带在雪梨身上，最后，克莱尔把挂坠扔进了工厂的熔炉里，引诱暴君跳入，所以这个剧情里，是没有人获得G病毒样本的，连雪梨都没有感染。