在《宝可梦XY》中，删除存档的方法其实很简单。如果你玩的是3DS版本，可以在不进入选择菜单时，同时按方向键、X键和B键，接着按照提示选择“是”即可删除存档。也可以进入游戏的设置界面，然后选择数据管理，选择“删除保存数据”，然后选择一个存档点击删除确认就可以了。