南阳地处南北方过渡带和东西部的分界线，横跨长江、淮河、黄河三大流域。南阳绝大部分地区属于长江流域，长江流域面积为23782平方千米，占全市总面积的89.71%。南阳北部有小部分区域属于黄河流域，占比不到0.1%，其余则为淮河流域，主要分布于南阳的桐柏、方城两县的东部地区，桐柏山是千里淮河的发源地。南阳河流主要有白河、唐河、丹江、淮河四大水系，长度在百公里以上的河流有10条，大部分河流适用《长江保护法》。
（1）南阳地区的长江流域：
长江流域覆盖到南阳地区的每一个县市，主要包括丹江、唐白河两大水系。淅川县丹江口水库是亚洲最大人工淡水湖，而南召县鸭河口水库是河南省境内的第二大水库，均属于长江流域汉江水系。淅川县还是南水北调中线工程的渠首所在地。较大的河流有丹江、唐河、白河、湍河、刁河、灌河、潦河、三夹河等。唐河干流上的郭滩水文站属于长江水利委员会汉江水文局。
（2）南阳地区的淮河流域：主要分布于桐柏县的东部、方城县的东部和东北部。桐柏县是千里淮河的发源地，其大部分地区属于淮河流域，桐柏县有淮河干流，而桐家河、月河、陈留河、五里河、毛集河等河流大多都属于淮河流域的一级支流。方城县的甘江河、澧河、沙河、贾河、桂河、澎河等河流，以及孤石滩水库、燕山水库，均属于淮河流域沙颍河支流的沙澧河水系。
（3）南阳地区的黄河流域：主要分布于南阳北部的小部分区域，最大可能位于西峡县的老界岭至大寺院一带，北与洛阳的栾川县交界，属于黄河流域伊洛河支流的伊河水系。
关于西峡县的黄河流域：西峡县大寺院以东至老界岭的以北区域位于栾川县境内，属于淮河流域伊洛河支流的伊河水系，因此西峡县的黄河流域或许就位于这部分区域内。而西峡县大寺院以西至西峡栾川卢氏三县交界处的以北区域位于栾川县境内，属于长江流域的老鹳河水系，所以这一段不会有黄河流域的区域。有资料指出：伏牛山主峰老界岭名字就是因为水系分界而来，老界岭以南的河流流入长江，以北的水流入黄河，老界岭是长江黄河流域的分水岭。
关于南召县的黄河流域：南召县的东北部与鲁山县交界，而鲁山县全境属于淮河流域，所以南召县的东北部不会有黄河流域的区域。南召县西北部一直到嵩县境内，属于长江流域的白河水系，所以也不会有黄河流域的区域。南召县北部与嵩县交界，分界线以北的嵩县境内属于淮河流域的北汝河水系，所以这一段应该也不会有黄河流域的区域。有资料指出：南阳的黄河流域在南召县境内，属于山区地形，流域面积极小，这里发育的一些小河流，最终汇入黄河。还有资料说：南召县北部的马市坪乡部分河流汇入嵩县的伊洛河，进入黄河水系，流域面积24平方千米。
（1）南阳地区的长江流域：
长江流域覆盖到南阳地区的每一个县市，主要包括丹江、唐白河两大水系。淅川县丹江口水库是亚洲最大人工淡水湖，而南召县鸭河口水库是河南省境内的第二大水库，均属于长江流域汉江水系。淅川县还是南水北调中线工程的渠首所在地。较大的河流有丹江、唐河、白河、湍河、刁河、灌河、潦河、三夹河等。唐河干流上的郭滩水文站属于长江水利委员会汉江水文局。
（2）南阳地区的淮河流域：主要分布于桐柏县的东部、方城县的东部和东北部。桐柏县是千里淮河的发源地，其大部分地区属于淮河流域，桐柏县有淮河干流，而桐家河、月河、陈留河、五里河、毛集河等河流大多都属于淮河流域的一级支流。方城县的甘江河、澧河、沙河、贾河、桂河、澎河等河流，以及孤石滩水库、燕山水库，均属于淮河流域沙颍河支流的沙澧河水系。
（3）南阳地区的黄河流域：主要分布于南阳北部的小部分区域，最大可能位于西峡县的老界岭至大寺院一带，北与洛阳的栾川县交界，属于黄河流域伊洛河支流的伊河水系。
关于西峡县的黄河流域：西峡县大寺院以东至老界岭的以北区域位于栾川县境内，属于淮河流域伊洛河支流的伊河水系，因此西峡县的黄河流域或许就位于这部分区域内。而西峡县大寺院以西至西峡栾川卢氏三县交界处的以北区域位于栾川县境内，属于长江流域的老鹳河水系，所以这一段不会有黄河流域的区域。有资料指出：伏牛山主峰老界岭名字就是因为水系分界而来，老界岭以南的河流流入长江，以北的水流入黄河，老界岭是长江黄河流域的分水岭。
关于南召县的黄河流域：南召县的东北部与鲁山县交界，而鲁山县全境属于淮河流域，所以南召县的东北部不会有黄河流域的区域。南召县西北部一直到嵩县境内，属于长江流域的白河水系，所以也不会有黄河流域的区域。南召县北部与嵩县交界，分界线以北的嵩县境内属于淮河流域的北汝河水系，所以这一段应该也不会有黄河流域的区域。有资料指出：南阳的黄河流域在南召县境内，属于山区地形，流域面积极小，这里发育的一些小河流，最终汇入黄河。还有资料说：南召县北部的马市坪乡部分河流汇入嵩县的伊洛河，进入黄河水系，流域面积24平方千米。
