如果把天庭和灵山都看成是同一家的话，就会发现主线剧情2-5章出现很多矛盾的地方，到了第六章还有王灵官和天兵天将来路上截杀天命人，这明显是不合逻辑的。很多人不细究的话就会喷游戏剧情差。
其实我们看主线，序章老猴子讲故事开始明显就是灵山视角下的说辞：天庭派兵打杀孙悟空，最后孙悟空身死六根散落，隐去了联合五大妖王抢夺瓜分根器的情况，并且紧箍的镜头只是隐隐给了一个画面(我甚至认为这是老猴子私自提到的紧箍，让玩家确定紧箍不是好东西，引出真结局)，基本是把锅全部甩给天庭。
1-3章的明线背景都是西天佛家势力引导天命人收集根器，第一章黑熊精基本是划个水就把根器还给你；第二章黄风是灵吉菩萨叛徒，灵吉菩萨全程引导你打黄风，在地图上清理黄风残党势虎先锋和石先锋，顺便还把灵吉自己讨厌的沙国王残党全图图了)，教训逆徒顺势把根器还给你。第三章黄眉明面上也是西天叛徒，在小西天自立山头当佛祖，和你打架也只用了人种袋，每个阶段都在劝诱你，第三阶段还明牌说了不用法宝，就是想打服你然后收你做徒弟，最后也是弥勒引导你去打杀他(死没死还不知道)，然后根器还给你。
这三章的共性就是黑熊精、灵吉、弥勒最后都是痛快的把根器还给天命人，boss战也没有发生明确意义的死斗，可以看得出来背后的灵山势力是希望你能快速集齐根器，这几关的经历更接近取经路上的历练，甚至有点能呼应上”重走西游路”。
到了四五章就会发现风格完全变了，第四章不管是盘丝洞还是百目魔君，对天命人明显是下死手的，紫蛛儿战和百目战明显是死斗的氛围(盘丝洞只是对八戒没下死手还只是紫蛛儿不忍心而已，百目他们还吐槽了)。然后通过四妹剧情、紫云山剧情和影神图，引出了天庭一方势力，末尾提到了妖王是天庭的黑手套这个事实，那么仔细看其实就可以发现，天庭势力是倾向于阻止并截杀天命人的。鹤仙人见到天命人的第一句话就是：“都第几世了，还是这般不通人情”换句话说如果天命人有轮回论的话，已经被天庭截杀/劝退不少轮回。
然后从这里开始就没有灵山的掌权人来引导天命人了，但是别忘了八戒明牌职位是净坛使者，也是灵山的编制，还是被天庭贬下凡的，同时是老猴子让他来引导你的人。第四五六章走入天庭控制区，灵山老大明显无法直接出面干扰，就默许八戒出面引导天命人继续收集根器。而第六章一进花果山就是一直被天庭派天兵天将截杀的状态，很明显天庭是不愿意看到天命人集齐六根的，不管是带上紧箍的傀儡结局，还是不带紧箍的真结局，都不是天庭想要的结果。