属性克制：最直接的方法是使用属性克制的招式。由于神奇守护特性仅阻止非最佳效果的招式，使用克制脱壳忍者属性的招式可以直接忽略这一防御，造成有效伤害。
天气影响：某些天气条件，如冰雹和沙暴，可以对没有对应抵抗能力的宝可梦造成伤害，即使它们拥有神奇守护特性。因此，通过改变天气状态，可以对脱壳忍者造成间接伤害。
间接伤害：使用如剧毒、撒菱等技能，这些技能虽然不直接造成伤害，但通过降低速度、造成持续伤害等方式间接削弱脱壳忍者。
无视特性：拥有“破格”特性的宝可梦可以直接无视对方的特性进行攻击，这也是一种有效的对抗策略。
非属性伤害：虽然大多数非属性攻击对脱壳忍者无效，但某些非属性伤害，如天气削血、道具伤害或异常状态（如烧伤），仍然可以对它造成伤害。
战术配合：在战斗中，通过合理的战术配合和宝可梦替换，可以有效地绕过脱壳忍者的防御，通过其他宝可梦的技能或状态来间接伤害它