游戏只有2个结局。【第一结局】：不打二郎神直接上山打大圣残躯，因为此前只集齐了大圣的眼耳鼻舌身5根，第6根意根是天命人自己进化的，最后天命人被老猴子成功戴上金箍，暗示天庭又培养了一个听话的大圣，符合之前台词“天命天命，听老天命令”。【第二结局】：打完二郎神，二郎神的第三只眼里冒出许多大圣的记忆，这里可以理解成杨戬帮助天命人集齐了大圣的意根，同时说明杨戬其实是大圣阵营的暗子，之前每章支线出现的隐藏boss都是杨戬安排手下磨炼天命的梅山兄弟。然后上花果山打败大圣残躯，在老猴要为天命人戴上金箍前，大圣猛然睁开了火眼金睛。众所周知剧情里天命人是没有火眼金睛的，即便收集到了眼根也没有，所以此刻睁开火眼金睛的是真大圣，随后的西游剧情倒叙也证明了这一点，那个敢大闹天宫的大圣回来了，至此游戏结束。