红色警戒系列中的超级武器包括超时空转换、核弹发射井、铁幕装置、天气控制仪（闪电风暴）、无畏级战舰。
超时空转换是一种能够将单位瞬间传送到战场上的任何位置的超级武器，主要适用于坦克和船只，但对人和狗无效。它主要用于突袭敌人后方，进行快速攻击
核弹发射井是苏联的超级武器，能够发射核弹，对大片区域造成毁灭性打击。核弹发射后留下的辐射带能继续对非免疫单位造成伤害，一段时间后辐射会消失。
铁幕装置是苏联的另一项超级武器，能够在一定时间内为载具和建筑提供无敌保护，无视一切伤害。这项技术使得被保护的单位在战场上几乎无法被摧毁。
天气控制仪也叫作闪电风暴，是盟军的超级武器，能够召唤闪电风暴，对大片区域造成伤害，极大程度破坏敌方基地内的重要建筑和生产设施，使敌方基地陷入混乱。
无畏级战舰虽然不是传统意义上的超级武器，但无畏级战舰的强大火力常常被玩家视为一种“超级武器”。其远程导弹能够造成大面积伤害，对敌人基地构成威胁。
这些超级武器各有特点，能够在不同的情况下为玩家提供战略优势，是红色警戒系列中不可或缺的一部分。