如题，源石计划之所以会被破坏，是因为清除矿石病就需要把源石解压，解压完了源石计划就破产了。然而终末地找到了办法，能治愈矿石病，这样就不需要解压源石了，源石计划能照常进行。所以前文明和现文明是可以共存的，实际最后也做到了。
那为什么会出现选择呢，是在小特给博士看花海的时候，博士就突然变了。而游戏外解密又提到了一个类似思想钢印的东西，叫“灰质销钉”，可能是玩意启动了，强行控制博士的思维，让博士降智，强行去为了前文明抛弃一切。实际博士就算知道了源石计划被破坏，以博士的智力，考虑出一个万全的方法不是问题，哪怕是找小特凯尔希商量，最后不行了再跳反当下下策也是可以。博士遇见源石被解压的反常举动，实在是有些ooc，在有了思想钢印的前提下才说的通。
所以目前而言，大家所谓的选前文明还是现文明，不过是在灰质销钉的影响下做的可笑选择，这玩意后来被小特直接消除了。没有选择，最后结果就是完美的，通过治愈而不是消除矿石病，让前文明和现文明最终都获救了。
所以巴别塔悲剧最大的原因，就是灰质销钉控制思想，把预言家封了，让博士做出了错误的选择。没有灰质销钉的话，博士有了预言家，当时就可以两个都要