市郊铁路项目的审批流程通常涉及省级和国家级两个层面。首先，市郊铁路项目需要得到省级政府的审批，这一步骤通常由省级发改委负责。在省级审批完成后，相关的批复文件会被抄送给国家发改委、住房城乡建设部、交通运输部、国家铁路局等部门1。这表明，虽然市郊铁路项目主要由省级政府审批，但国家层面的相关部门也会参与到项目的审批过程中。 此外，根据提供的信息，2023年共有16项市域(郊)铁路项目获得了国家、省级发改委、自然资源部、市政府等的批复，批复内容主要包括工程可研报告、初步设计、建设规划、用地批复等，这些信息进一步证实了市郊铁路项目在省级审批的基础上，还需要国家层面的相关批准。
综上所述，市郊铁路项目的审批确实需要国家层面的批复，但这一过程是在省级审批完成后进行的。
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