1873年（明治6年）明治政府实行新征兵制，但是由于海军的职务特性和复杂程度（武士因为家学都识字学东西省掉了识字的过程而且学习新东西也快）还保留和普遍重视志愿兵制。甚至在1871年就颁布各府县由地方官从18～25岁身体强壮的男性志愿者渔民中选拔海军士兵。这导致了很多因政权更迭而家世没落的武士加入海军。（藩仇家仇加上阶级对立和当时日本内战时海军出力甚少要钱还多，等等原因加起来从创立初期日本海陆两军的矛盾已经从根上就无法解决了）。

颁布征兵令后，海军是两令并存的局面，但是开头时间里，海军还是采取单志愿兵制。因为海军不管是水兵还是轮机兵。都需要比陆军士兵要求更高的操作技术，技术只能靠时间去磨练。而征兵制规定的时间难以掌握这些。
1887年（明治20年）以后，海军人数增加，全面实行征兵制，虽说如此。从1904年数据来看。征召的士兵1578名，志愿兵3040名。日俄战争主力还是以志愿兵为主。（1871年武士阶层在海军人数比例高达90%新征兵令的出现到了1891年普通家庭出身的才占21%1901年时也不过才达到34%）而且为志愿兵提供各种晋升军官的通道，越优秀越可以长期留任，以此保留人才。

海军的基础除了炮舰，人才更为重要。培养军官第一步措施就是建立系统的培养体系。开办学校是最直接体现的方法。前面提到的军务官在1868年7月14日就对天皇上过奏折
“耀皇威于海外非海军莫属，当今应大兴海军，然而草创之今日。国内叛乱尚未平定，军费巨大。故造船冶炼等大工程应逐次进行。否则非国力所能承担。况且应首先网罗精通技艺之士，从事海军训练、编制和造船冶炼等方面工作。有鉴于皇国精通上述技艺之士甚少。故兴办学校为建设海军之根本。拟在兵库创办学校，以建立海军之基础”
天皇于10月下令“海军之事为当务之急，应从速奠定基础”。

于是1869年9月原幕府的海军操练所重开，1870年1月11日举行开学典礼。命令从萨摩等16个藩选派志愿者。还招收了100名左右的走读生。
1870年（明治3年）5月4日，兵部省提出一份有三部分组成堪称创立海军基本论调的建议书。

1.关于迅速建设海军、认真加上陆军、建立保护国家体制的建议。
2.大办海军的建议
3.英法等七国国防力量和军备表

第一份文件最后论及军费，指出西方各国军费达到岁入的三分之一，战时甚至是三分之二，日本就算财政拮据，今后七年也应该拿出五分之一作为军备。
其中第二部分是“大办海军”的建议，将“海军军官教育”专列一项。再次强调培养军官的重要性。指出“军官是灵魂，没有灵魂，水手无法发挥其所长，舰船则是一堆废铁。军官掌握知识深奥，达到精通并非易事，故而尽快创办学校，广选良师，培养人才”是头等大事。同时引用英国历史教训。最后确定日本20年内应拥有大小军舰200艘，常备军队25000人（这个提议被山县有朋等人直接否决）。
第三份是英法德等国的资料文件用来佐证第二份文件
1870年十月通告全国：海军和陆军分别采用英国和法国的方式（当然海军制度真正确立是3年后的事）。

1870年11月海军操练所改名兵学寮。取消走读制。根据新规又招收15名少年生（15-19岁）和29名成年生（20-25岁）。被后世誉为明治海军之父的山本权兵卫，就是15名少年生之一。兵学寮第一任校长是海军大辅川村纯义，第一批教官集合了当时不少学术界的权威。但是由于无经验的教育模式和制度改革频繁。所以第一批学生并没有取得重大成果（1870年入学的110名学生只有2人坚持完成学业于1873年毕业，因此川村纯义决定改革）。
一直到了1873年重金聘请英国海军少校阿奇博尔德·道格拉斯（Archibald Douglas）率领的一个34人的教官团的到来（军官6人，士官12人，水兵16人），虽然作为现役军人的他并不掌握最前沿的海军技术。但他率领的使团在日本一直待到1879年，按照英魂模式重新建立一套学习体系和规章制度，使日本海军培养教育才算步入正轨。

1879年又聘用英国皇家海军少校L.P威兰（L.P.Willan）受雇讲授炮术和航海术。他的学生里有奠定海军炮术地位并在清日、日俄战争里大放光采的岛村速雄、加藤友三郎、吉松茂太郎。

1876年（明治9年）兵学寮改名海军兵学校。1888年8月1日。学校搬到了后世大名鼎鼎的江田岛（国内很有精神的昭和海军梗的原型地）。江田岛海军兵学校是甲午前日本唯一的海军基础军官学校，学制五年。

1873年10月海军兵学校又设立轮机专业，1874年设立横须贺分校，轮机专业迁往分校。在之后的20多年里，轮机专业不停的在分离和合并到海军兵学校之间来回折腾。一直到1893年12月恢复为轮机学校，并在1925年（大正15年）迁到舞鹤。
海军财会学校前身是成立于1874年的东京芝山内天神谷海军会计学校。海军军医学校前身是1873年在筑地海军医院内的海军医院学校。

明治初年又开办了炮兵、水雷、通信、航海和工程等一系列学校。明治21年（1888年）在东京筑地又成立海军大学校，是日本海军最高学府，设有将校科、机关科、军医科。首任校长是井上良馨海军少将（云杨号舰长）。同时聘用约翰·英格尔斯上校为海军大学校教官和顾问。也是在他的建议下海军大学校又增设了数学和物理学科。英格尔斯在执教生涯中（1887~1893）最大的贡献了并不是对日本海军技术教育的贡献，而是给这帮海军未来学生讲授一系列现代海军战术课程。这些课程涵盖了不同科目——现代蒸汽舰队的组织、队形、调动、战术、以及封锁、对陆地要塞的压制射击。最终于1894年在日本结集出版为《海军战术讲义录》。
同时日本还有两所归镇守府管辖的学校，分别是海军炮术练习所和海军水雷练习所。因为地址都在横须贺，所以隶属于横须贺海军镇守府。

海军炮术练习所由1881年炮术练习舰转变而来。1893年正式与岸上建设校区。是培养专业炮术士兵和军官进修的地方，不直接招收平民。甲午海战前有练习舰4艘“浅间”“凤翔”“天城”“海门”。
海军水雷术练习所的前身是1879年设立的水雷术练习挂（原文是日式汉字掛机构单位词）原设于东京、后变更为水雷练习所。1893年迁至横须贺更名为水雷术练习所。跟海军炮术所职能类似是专业针对性比较强的海军进修类院校（数据出自陈悦《中日甲午黄海大决战》57页）

海军各种技术光靠外聘教官教学是不够的。于是派人出去学这个选择甚至要早于兴办学校。幕府时代1862年（文久2年）就首先派了15人去荷兰学习。其中就有对日本军改做出巨大贡献的后来甚至晋升到政府军中将的幕府海军领袖榎本武扬和造船权威中将赤松大三郎。
1865年萨摩藩也派遣留学生出国。其中就有多次担任海军兵学校校长的松村淳蔵中将。
明治海军操练所建立后，1870年（明治三年）日本同英国签订为期三年的合作。派遣2名学生到英舰“奥的斯阿斯”号实习（前田十郎卫和伊月一郎）。
1871年从海军兵学寮和舰艇军官里选出14名去英国4名去美国（日俄战争出名的东乡平八郎就是最早的一批留学生之一，不过英国不允许他们去军校学习，所以他去的商船学校，最后他乘坐“比睿”号与1878年5月回到了日本，中日海战中的坪井航三去的是美国）。

截止到1887年外出留学的大约人数。英国25人美国21人法国6人德国1人，军舰实习的英舰5人美舰3人德舰8人。到了1907年总人数。英国71人，美国30人，法国29人，德国11人，其他不详9人一共150人。
虽然留学生带回来的先进技术和制度对日本海军建设做出了巨大贡献。但是荷英法德美各国的海军重点和发展方向不一样也导致了日本海军前期发展极其混乱。这问题一直到了道格拉斯为首的海军教官团的到来的十几年间奠定了日本海军以英国为学习目标的主基调才得以解决。当然这也有海军其他学校外聘教官大多数为英国人有关。1876年统计的外教和技术人员有469人（东烟精一著《日本资本主义的形成》）。
理论学习后总要实操来检验成果。然后当时日本的内战大多数是因为明治政府新税和征兵制引发的民众一揆，海军除了运输物资实无他用。那远航是一个综合观察人员技术突发情况应对和长时间离岸的心里变化的选择。