大融合后很多世界融合在一起,忍者们和很多人都失踪了。阿林是在大融合中被忍者救下且幸存的人。在忍者失踪后为了传承忍者的精神励志成为一个忍者且自学了幻影旋转术。在这过程中认识了从帝国逃出来的索拉。再一次意外中为了救被帝国猎捕的龙(阿尤)发现了索拉的隐藏力量可以被龙激活,且遇见了劳埃德。忍者们为了保护龙族与帝国对抗,这个过程中凯,妮雅,赞,寇依次回归(寇根据吴大师的声音独自去寻找吴大师)(遇见了一个从小被龙养大的热元素大师怀尔德菲勒)。和女皇最后的决战时,索拉放下了心中对父母的顾虑,接受了心中科技元素力量打败了女皇,劳埃德吸收神龙能量封闭了融合之震拯救了世界