但是相对于平时那些种田养生的联机模式，《沙石镇时光》的多人在线合作模式则是跟单机不同，在正式版大更新之后，你启动游戏的时候会提示你是想要单机还是多人联机，选择多人联机后，则是进入了一个跟单机不一样的界面。并且你可以在界面中进行多人和单机的跳转，多人的存档跟单机的存档进行独立开。
通过服务器选择之后，登录游戏，选择是加入别人的城镇还是自己创建一个城镇，你可以邀请除你之外的三名小伙伴（一共四名）加入游戏，开始进入游戏，跟单机剧情的邀请工作不同，你跟你的小伙伴们以及众多的商人是一起骑着骆驼来到沙石镇，在这里的沙石镇还是百废待兴的模样，你们就是这里的开拓者，并且路上遇到了蜥蜴人，一番剧情后（CG动画都感觉很卡顿）进入游戏，你们被邀请来到合作工坊，你们可以最多四个人一起在这个工坊内操作
大体内容和单机基本一致，但是因为是多人联机的关系，这就类似于一个服务器，任务和工坊声望大家都是互通的，并且有个任务共享储物箱，方便联机的伙伴完成任务。而且还有了里程模式（游戏内置任务系统），有单人的也有多人一起的。技能也与单机模式略有不同，更有针对性的四大技能树给你统一放在一起，不需要单独去刷某个知识的经验值，体力也与单机的不同，联机模式下你升级可以体力全回满，并且离开游戏之后回来会根据你离开游戏的时间给你当做休息计算你恢复的体力。并且多人联机的情况下，可以搜集的资源和刷新速度都是大幅度提升。
多人之后开启的一些玩法也与单机略有不同，你们可以一开始修建幸运雕像（黄金蛙蛙）每天摸一下可以获得不同的祝福，并且可以去行政大厅开启沙盘，因为是我们是可以说第一批的入驻沙石镇的人员，所有的建筑都需要我们自己进行建造和开发，我们可以承接任务大力开发城镇的新建筑和功能，可以说是你们四个人，就是妥妥的市长了，只要你们够努力，这个城镇就会被建设的更加美好。