快递已经发出，但系统尚未入库可能有以下几种原因：1. 可能是单子是问题件，比如遗失、破损等。需要向发件网点查询具体情况。2. 发件方操作人员失误导致货物没有录入系统。建议联系物流公司处理。3. 如果确认已寄出，却迟迟不见物品到达，可能是因为运输过程中某一环节脱节或衔接不紧密（如中转点长时间没更新信息），或者因为中途发生变更目的地等情况。此时需主动与快递服务提供商沟通并查清原因。4. 还有可能收件人收到包裹后由于某种原因拒收了此包裹，但是快递员并没有将这个情况反馈到数据库层面，所以造成库存未更新。这种情况下只需等待一段时间就会有新的数据出现。5. 系统滞后或不兼容也可能影响信息的准确性和实时性。6. 最后一种可能性是在派送时掉了客户的快递通知短信，这种情况也比较常见。客户可以尝试拨打客服电话咨询一下此事。请注意，以上只是一些可能导致问题的原因，具体情况还需要根据实际情况进行分析和判断。