有剧透慎入，不小心点进来的你还有看完这行字的时间退出去。建议至少通了一周目再来看。
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一、匹诺曹宇宙的基底世界观：
在古早时期有一颗星星化作神明，回应人类的愿望降临世界，这个神很可能就是大教堂那边崇拜的有翼天使。
神为了赐予人永生而来，但是只有一部分人能够承受这种赐福，承受不住的人则会死。
自此这个世界上有了一群永生者，他们将会是未来串联匹诺曹宇宙的线索人物。
之后人类出于未知原因杀害并且肢解了神，神的肢体变成了类似圣遗物的存在，流落各地不同组织手中，不出意外以后也会是串联匹诺曹宇宙的关键线索，LOP这一作中出现的是“神之左臂”，为炼金术师团所拥有。
神赐予人类永生的过程中诞生了很多“准永生”的副产物，石化病就是其中之一。
石化病会把人的情感与记忆冻结在体内，这样虽然肉体不能行动了，灵魂却永生了。
石化病人的肉体“死后”会变成自我素晶体，同时向外传播孢子，继续传播这种“福音”。
二、古早期的克拉特：
克拉特有两大特产：鱼和石化病，石化病在这里传播的历史能溯源到中世纪，最终通过将病人全部隔离在深坑里得以平息，这个过程让克拉特地下积蓄了大量的自我素晶体。
但是彼时的克拉特只是个贫瘠的小渔村，这些晶体也就被忽视了。
三、炼金术师团的到来：
不就之后，炼金术师团带着神之左臂来到了克拉特，起初他们并不受到大主教的欢迎，但是他们给的太多了。在巨额资金援助的诱惑下，大主教接纳了炼金术师团，此时也成为了大主教之后最大的悔恨。
之后炼金术师团上通过和当地贵族联姻（狐狸姐就是出身在贵族x炼金术师的联姻家族），下通过资助教会，迅速地成为了克拉特市的实质统治者。
也就是这个时期，他们发现了地下的自我素结晶，并向外邀请了包括吉佩托在内的各路人才前来研究。
四、人偶的诞生以及自我素的研究：
在吉佩托的才华下，自我素作为人偶的动力源给克拉特带来了天翻地覆的变化。但是在早期不知为何，会有一些人偶违背程序设计作出违规之举，典型案例就是谜语之王杀害了维尼尼的双亲这桩案子。为了处理这些违规人偶，成立了追缉者这个组织。
追辑者的成员来自两部分，一部分是脱离了贵族的人员，被称为“遗族”，打扮和战斗风格都比较华丽美观，比如说狐狸姐。
另一部分是贫民窟出身的“清道夫”，武器和战斗风格突出一个粗旷实用，比如黑猫小弟。
情况在另一起违规人偶事件后发生了转机：
一个生前就是女仆的女仆人偶竟然想起了自己的前世，并试图寻找自己的孩子，这个女仆人偶被炼金术师团捕获并遭到审讯与拆解。
在审讯与拆解的过程中，他们发现了人偶的外观与职业设定与生前越接近，灵魂觉醒的概率就越高，这也是之后P和卡罗原身几乎一模一样的原因。
因为炼金术师手上有神之左臂，所以他们马上意识到了自我素就是一种“准永生”产物，并立刻着手进行肉体与灵魂双重永生的实验。
在研究的过程中诞生了一种失败产物“万灵药”，这玩意可以防止石化病的患者变成石头，但却反而让病人变成了近似“活尸”的怪物。这种失败产物后来被药剂师偷走并造成了贫民区的大灾难。
研究的另一个副产物就是大契约，通过大契约约束人偶，从而最大限度的避免了人偶不听话的问题。只不过负责写程序的吉佩托在大契约里留了一个后门，即零号法则，让他自己拥有对所有人偶最高优先级的控制权。
五、吉佩托父子和玫瑰庄园事件：
吉佩托有个儿子，但是父子关系并不好，父亲沉迷工作对儿子卡罗爱答不理，将儿子长期丢在孤儿院玫瑰庄园内。但是吉佩托本人却称这段时期是“happier time”。
在玫瑰庄园内，卡罗结识了罗密欧，并且在罗密欧的影响下逐渐变得叛逆，最后拜一名女性知名追迹者为师，学习了战斗技巧并成为了追迹者学徒。
虽然还没有从师傅那里得到面具，但从人偶之王的留言里可知本来的卡罗在战斗方面就比较有天份。
但之后因为炼金术师团的未知研究（dlc预定？），玫瑰庄园暴发大规模的石化病，卡罗、罗密欧、炼金术师团前领袖都死于这场事故，西蒙上位。
六、神之复活实验与人偶狂乱：
西蒙上位后，转变了炼金术师团的研究方向，放弃了直接利用自我素实现永生的尝试，新的目标是利用自我素与神之左手复活被肢解的神明，再一次让全人类接受神的赐福。
为此需要三个条件：神之左臂、大量的高质量自我素以及能够承载神明的肉体。可以简单理解为召唤媒介、神的灵魂容器以及神的肉体。
神之左臂本来就已经有了，在自我素与肉体方面西蒙则是和吉佩托合作分别从两方向着手。
西蒙负责改良“万灵药”最终制造出足以承载神的肉体，吉佩托则负责引发人偶狂乱，并在狂乱中激发出强大的自我素。
为此炼金术师团一方面改变了供给维尼尼的自我素种类，现在他们提供的不是由地下矿石产出的自我素，而是自活人以及刚死不久的石化病人身上提取出来的，这些自我素更容易发生觉醒现象。
另一方面西蒙在月光镇的水源中直接下毒，制造了大量的活尸（待续……）