要计算原神全探索度100%有多少原石，需要分别计算各个区域的原石数量，再将其相加。根据已知信息，可以计算出须弥雨林部分的原石数量：须弥雨林部分共有6个区域，玩家将6个区域的探索度达到100%时，可以获得5580原石+4个纠缠之缘，换算成原石为**6620**原石。同理，可以计算出须弥沙漠部分的原石数量：须弥沙漠部分在3.1版本中开放了3个区域，玩家将3个区域的探索度达到100%时，可以获得3091原石和2个纠缠之缘，换算成原石为**3311**原石。将须弥雨林部分和须弥沙漠部分的原石数量相加，即可得到原神全探索度100%时的原石数量：6620 + 3311 = **9931**原石。因此，原神全探索度100%时有**9931**原石。