从南京科巷去地铁口最近的地铁站是南京安德门地铁站，从浦口区政府步行10分钟即可到达。此外，从南京科巷也可乘坐公交线路12、33、41、55、80、304、661至民族路站，然后乘坐公交线路531、973至安德门地铁站，换乘安德门线可至南京市各个地铁站。此外，也可以从建邺区的南京梅园地铁站坐地铁前往南京市内不同地点，也可以从对面硕放路站乘坐公交线路100、303、312、652、821至南京安德门地铁站。此外，还可以从南京火车站或南京南站乘坐地铁前往南京市内不同地点，乘坐南京轨道交通1号线可至中胜、安德门等多个地铁站，方便快捷，是南京市民出行的首选之一。