通过骨穿检查，医生可以了解骨髓造血细胞的增生情况，细胞形态有无改变。对败血症或某些传染病患者行骨髓细菌培养，可提高细菌培养的阳性率。部分恶性肿瘤患者，通过骨穿可以发现骨髓转移。
所以，骨穿对各类血液病、某些感染性疾病及恶性肿瘤的诊断、指导临床治疗有着非常重要的意义。部分患者需要多次骨髓穿刺才能明确诊断。骨穿是重要的检验方法，多数情况下要结合其它检验一起来诊断疾病。