民用无人机驾驶员合格证有效期为两年，合格证持有人应在有效期满三个月内提交更新申请，即日起可登录“云合格证”APP进行合格证更新。
以下为《关于民用无人机驾驶员合格证更新有关问题的通知》内容：
一、依据
依据《民用合格审定规则》
第013条：民用无人机驾驶员合格证有效期为两年，合格证持有人在有效期满后不得继续行使该合格证赋予的权利。合格证持有人应在合格证有效期满三个月内向无人机管理办室申请重新颁发合格证。
二、有效期内等级的变更
合格证持有人如在合格证有效期内参加并通过了增加类别、级别及合格证等级要求的考试，则由办公室为其颁发签注新加等级的合格证，且原合格证及相应等级的有效期将与新加等级合格证的有效期相一致。
三、更新方式
视距内驾驶员与超视距驾驶员合格证持有人在其合格证有效期内，如在无人机云系统上积累的个人飞行经历记录时间不少于100小时,则其持有的合格证有效期满三个月内进行合格证更新申请，只需更新个人信息,不必参加并通过合格证更新考试,就可以更新持有的视距内驾驶员或超视距驾驶员等级合格证。
除以上情况外，如持有多个合格证等级，只需要从中选择最高合格证等级（视距内驾驶员低于超视距驾驶员，超视距驾驶员低于教员等级）要求的考试科目及标准进行更新考试，通过后所有合格证都将更新并皆可换发新证（所有合格证级别等级都依据考试使用无人机的级别等级）。如选择了非最高合格证等级要求的考试科目及标准进行更新考试，通过后不高于该合格证等级的所有等级都将更新并换发新证。