十二指肠肿瘤最主要的治疗方法是进行手术切除，无论是十二指肠的良性肿瘤，还是早期的十二指肠恶性肿瘤，手术切除治疗是最积极有效的治疗办法，具体治疗方法要根据肿瘤性质进行分析，如下：
1、十二指肠良性肿瘤：仍然可能会在病程发展过程中导致肠套叠、肠梗阻、出血、穿孔等严重的并发症，而且有一部分十二指肠良性肿瘤，如绒毛管状腺瘤、平滑肌瘤等，存在着恶变的风险。所以这部分病人一旦明确诊断之后，应该积极地进行手术治疗。
2、十二指肠恶性肿瘤：如果十二指肠恶性肿瘤仍然处在早期阶段，可以进行根治性的手术切除，手术切除是积极有效的治疗办法。如果十二指肠恶性肿瘤已经处在晚期阶段，可以采用化疗等方式来控制病情的发展。