究极球和大师球的区别是捕捉的精灵是不同的，捕捉率也是不同的。
1、究极球的效果：若目标是虚吾伊德、费洛美螂、爆肌蚊、电束木、铁火辉夜、纸御剑、恶食大王、砰头小丑、垒磊石、毒贝比、四颚针龙的究极异兽，捕获率×5，否则捕获率×0.1。

2、大师球的效果：捕获率*255，收服野生宝可梦必定成功。