在重生细胞手游中，死亡机制就是玩家从第1关到被囚者牢房中死亡后，会在起点复活，因为这里是主角的出生点。玩家死亡后所获得的装备、变异、细胞、血瓶都会丢失。
死亡后所保留的东西有：交给收藏家的图纸（PS：已经解锁的图纸），消耗细胞升级的进度，铸造师的全图装备品级提升，击杀王手获得的起源细胞，成就和部分金币。
装备从宝箱和商店随机刷新，杀怪会掉武器/变异的图纸，拿到图纸活着带到收藏家那里，消耗收集的细胞就能解锁。解锁后便会直接获得一把武器/变异。后续已经解锁的武器，会变为随机获取。