大家好，由于《古墓丽影：崛起》的文件实在太多，串联起来内容过于复杂，我查阅了大量的内容和资料，根据内容简化了一下，将内容的精华串起来给大家讲一下《崛起》故事的起因和大致内容。

故事前提简介：在日本龙三角邪马台惊悚的冒险中，劳拉·克劳馥已成为一名真正的勇士。在那里，她窥视到了更深层、更隐秘的世界。她亲眼见到了超自然的不朽生物，为了证明她曾经看到的一切并非妄想，劳拉决定去寻找Kitezh（基特城），一个在西伯利亚被发现之后却又消失的迷之城市。
劳拉从日本龙三角生还后，实力强大的神秘组织圣三一压下了邪马台事件并利用舆论和媒体打压劳拉，同时持续监视她。
基特城的介绍：公元13世纪，弗拉基米尔的君主乔治二世创建了Kitezh（基特城）
先知雅各故事的介绍：公元10世纪，君士坦丁堡出现一位先知，一位睿智从容，屡有神迹的人物，很快拥有了大批民间追随者。（先知有为人疗伤，让敌军放下武器甘心臣服等在墓室中壁画表现的故事）。
7年后，先知的影响力越来越大，教廷斥之为异端，授意其下的“黑手套”圣三一组织将其铲除。由于在君士坦丁堡待不下去了，先知和他的信徒前往叙利亚另辟家园。圣三一派出骑士将先知杀害，并把先知葬在叙利亚隐秘墓地。
但是先知随即复活，众信徒欢欣鼓舞，追随者更加庞大。圣三一恼羞成怒，加紧迫害先知及其信徒，派出军队意图斩草除根，同时也意识到先知可能会有某种神秘的力量，意欲占为己有。
先知及其追随者不得不向东方迁徙，并在西伯利亚某处定居了下来并建造了基特城，过上了桃花源般的生活，逐渐消失在西方视野中。
此后过去了200年，中国国内到了元朝时期，成吉思汗统一蒙古高原，开始四处征伐。
圣三一深知先知的影响力，其间一直派出杀手寻找先知及其追随者的踪迹，赶尽杀绝（即游戏中主题为“猎人”的文件讲述的故事）。
圣三一一直在寻找先知的踪迹，并派出使节与蒙古军队联合，随同蒙古军攻城掠地，暗中调查先知线索。圣三一使节在随同蒙古大军入侵俄国时发现了基特城的地图，使节向蒙古军描述基特城的富庶，欲借蒙古大军之力完成其更深层次的目的，大军围城，惨烈战争一触即发。
在大战一触即发的前夕，先知为了保护圣物，毅然决定释放圣物的力量组织了不死军团。并在守城战事即将崩溃时转而攻击冰川，雪崩埋葬了基特城，蒙古侵略者、圣三一使节、不死军团都被埋在城内。军团在被埋葬的城内逐渐肃清蒙古侵略者，圣物得以保存。
圣三一使节在被埋的城内艰难求生，挑落单的不死军团士兵下手，但随后却发现他们死后第二天就会复活，使节在绝望中死在城内。
由于基特城被埋，先知消失了一段时间，但随后再次出现在大家面前，先知和追随者在城外的地热山谷内继续生活，守护圣物，繁衍生息。
再此后过去了700年，他们的活动范围逐渐扩大到山谷外的西伯利亚雪原。
进入到了20世纪30--40年代，一支苏联军队将铁路修到了山谷里，再一次打破了这里的宁静。除了随军而来的苦力和囚犯，苏联军队还逼迫当地人为他们劳作开矿，开矿的进程逐渐影响到基特城的安全。当地人开始暗中破坏开矿设施延缓施工进度。为此，当地人与囚犯暗中合作，在囚犯暴动时击溃了苏军，为了守护秘密不留一个俘虏。
《古墓丽影：崛起》故事的开端介绍：
进入20世纪60年代，理查德·克劳馥爵士（劳拉的父亲）出生，一生潜心研究考古，成为世界闻名的考古学家。后期逐渐开始研究神话和现实的关系。由于他过于玄幻的研究内容遭到主流学术界的嘲笑，而他在图书馆中巧遇未来妻子即劳拉的生母艾米莉亚，两人的恋情遭到艾米莉亚家族的强烈反对，但她毅然与家族决裂，投奔爱情。此举被在新闻界比较有影响力的亲弟，也就是劳拉的舅舅记恨在心。
时间来到20世纪70年代，苏联势力再次染指了这片土地，并比之前涉足更深，并且军队发现了大量遗迹和线索。当地人各种游击反抗，并逐渐开始有组织地抵抗，最终苏军全军覆没，基特城的秘密得以保留，当地人再次过上了平静的生活。
同时，在苏军内部也渐生变故，一对富有反抗精神的青年（男看守，女囚犯）在劳动营内互相爱慕（并育有后代），他们的破坏活动被苏军发现，男青年开始遭受迫害，但最后活下来并融入当地人中，女青年逃入深山，利用自己的化学知识和当地传说的背景制造了女巫山谷（即邪恶的山谷），苏联人不敢涉足（女巫DLC情节）。
进入20世纪70--80年代，先知与一位当地女青年相爱，育有一女，即游戏中的索菲亚。
20世纪80年代，女神劳拉·克劳馥出生。幼年时母亲在西藏不幸遇难（克劳馥庄园DLC中有提及）。这时理查德的研究引起了圣三一的注意，他们派出安娜接近理查德，乘虚而入并与他结婚，成为劳拉的继母。
20世纪末21世纪初，理查德·克劳馥爵士对先知和圣物的调查使圣三一高度警觉，他们利用其精心准备的公开学术报告却遭到世人嘲笑诋毁，事业和精神大受打击的机会，派出安娜的弟弟康斯坦汀杀害了理查德（康斯坦汀可能没有亲自下手，但应该参与了全过程），并伪装成自杀（死在家中，头部中枪，桌上散落诋毁他的报纸，这些负面消息报道极有可能是劳拉舅舅在背后推波助澜）。正值少年的劳拉对此难以释怀，发誓恢复父亲的名誉。
21本世纪初，大学毕业的劳拉与亲如长父的父亲生前好友罗斯，大学好友萨曼莎，共同出海探寻世界的奥秘，结果遭遇海难流落荒岛。劳拉艰难求生，逐渐成长，并最终带领大家成功获救，船上大厨约拿随同劳拉一同奔赴西伯利亚调查基特城的踪迹，而好友萨曼莎获救后被PTSD折磨，与劳拉断绝了往来（安娜安排的心理医生的诊疗录音里有提及）。
回国后的劳拉对父亲之死难以释怀，调查父亲的研究成果，线索指向了叙利亚，同时圣三一也逐渐摸到了先知和基特城的脉络，数条线索交织在一起，展开了劳拉在崛起中的故事。