在产品运用中，混合离子交换器的出水水质能制取纯度相当高的成品水，但混合离子交换器的再生过程较阴、阳离子交换柱的再生工艺复杂，且再生效率低、再生后树脂的工作交换容量也较低，再生成本高于阳床或者阴床。
因而混合离子交换器适用于进水含盐量较低的场合（例如经一级复床除盐后的深度除盐或高纯水系统的精处理）。

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