安南投诚以后，从此按时进贡，和清朝一直来往密切。康熙皇帝曾经派人册封黎维禧为安南国王，并且同意了他的请求，将贡期由三年一贡改为六年两贡并进。从此，安南彻底成为清朝附属国，双方的关系一直不错，但是到了1788年，话说越南有个地方实力派，名叫阮惠（又作阮文惠），当时属于郑阮纷争时期南方旧阮的领地之内。因不满旧阮政府里权臣当道，政局败坏，阮惠便与兄长阮岳、阮侣于1771年，在西山发动起义。阮惠在战事中表现骁勇以及足智多谋，使西山阮氏兄弟势如破竹，先后消灭南方旧阮、北方郑主并且击退了暹罗入侵的干涉军。
图为康熙皇帝读书像，阮郑之争

阮惠毅然向安南国王发起挑战，并且迅速攻破安南的国都黎城。国王黎维祁狼狈逃走，王室200多人由大臣阮辉宿、黎炯率领逃往广西向清军求救，由高平府登舟，逃至广西太平府龙州斗奥隘对河求救，并冒死涉水登北岸。过河男妇老幼62人，没来得及渡河者尽为南岸追兵所杀。阮惠结束了越南二百多年来南北分裂之局。
图为：皇清职贡图中描述的安南人风饰两则

1788年西山朝的北伐攻破后黎朝的都城昇龙（今越南河内市）之后，后黎朝的昭统帝逃往保禄山，派清亲信大臣阮辉宿、黎炯向清朝求救，并且宿护维祁母、妻、宗族至龙州（属广西太平府），广西巡抚孙永清及总督孙士毅疏闻，孙士毅很快上书乾隆皇帝调兵援越，孙永清出驻南宁，奏太平设军需局，以福建延建邵道陆有仁、桂林知府查淳董其事。清朝与后黎世代交好且有约定在先。于是正值鼎盛的大清乾隆帝便派孙士毅为主帅挥师攻入安南境内，欲让黎昭统帝复位。

孙士毅向乾隆帝上表奏称此事，建议乾隆帝发兵讨伐安南，扶昭统帝重登皇位。而孙永清则提出不同的观点，认为当时后黎朝势力弱小西山朝强大，后黎朝必然会被西山朝灭亡，建议按兵不动。乾隆帝与内阁大学士和珅商量之后，决定出兵安南。其出师的真实目的，中越史料中记载不同，《清史稿·越南传》称其目的是兴灭继绝、灭阮扶黎，原非利其土地；但越南《大南列传前编·伪西列传》则有在中国史料中不曾出现的说法，称孙士毅曾向乾隆帝提出出兵安南后，发兵镇守安南，扶昭统帝继位担任傀儡皇帝。
图为乾隆行服及和珅朝服像两则

清廷根据奏报，陆续做了如下布置：
第一、妥善安插黎氏眷属及随从人员，优给廪膳，勿使失所。并派兵保护，保证其生命安全。
第二、调兵驻守各关隘，整饬兵马、器械，朝夕操练，造成清朝不日即将出兵的声势，以此威慑阮惠，声援黎维祁，希望黎维祁借此声援，招集义兵，徐图恢复。
第三、檄谕安南高平、谅山等处镇目，应拥戴旧主。广发檄文，发动政治攻势，对阮惠营垒予以分化瓦解。
第四、阮氏逐主乱常，不许其进贡纳款，于镇南关对其贡使“大声呵斥，并谕以天朝已调大兵，分路进讨”，同时令进贡夷官归谕阮惠迅速悔罪自新，迎还故主。对阮氏政权不予承认，施加政治压力等等。希望通过黎维祁依靠旧臣拥戴，或阮氏悔罪迎还故主的方式达到黎氏复国的目的。

1788年，孙士毅奉旨，调两广、云贵之兵出征安南。孙士毅与提督许世亨率两广兵一万出镇南关（今中越边境友谊关），镇守谅山的西山将潘启德投降；阮文艳逃往京北（今北宁省），与京北留守阮文和并力守城。
孙士毅遂以八千人直捣昇龙，以二千人驻守谅山为声援。
田州知府岑宜栋率军进入高平。
云南提督乌大经率部八千人取道开化府的马白关（今云南文山市马关），渡过赌咒河（今中越边境的盘龙河），进入宣化镇。
云贵总督富纲驻守都龙（在马白关之南），负责监督粮饷的运输。同时移檄安南各路，劝各地西山军投降，其发兵征讨檄文称：“念安南黎氏，本天朝贡臣，三百余年执壤奠虔供厥服，一十五路，锡土封奄有其邦。乃于乾隆年间，国酋阮岳、阮惠等，称兵作乱，袭破罗城。前黎王忧惧物故……
大皇帝矜恤黎氏之丧亡，不忍交州之涂炭，特命督抚佩征蛮大将军印，调兵五十万，直抵罗城，明正阮岳等罪恶，无容得以逃天之诛。该国世戴黎王，久蒙豢养，知能不泯，感发由衷，不可丧其天良，忘君从敌……”

两广总督孙士毅：
孙士毅（1720年—1796年），字智冶，一字补山，浙江仁和人，清朝大臣。乾隆进士，原为文官，历任内阁中书、侍读、编修、太常少卿等职。后出任山东布政使、广西巡抚，旋署两广总督。
乾隆五十二年（1787年）设防潮州，阻防林爽文起义军进入广东。翌年率军参与安南之役。封一等谋勇公，授兵部尚书、军机大臣。乾隆五十六年（1791年）授四川总督，保证了平定西藏廓尔喀之役的粮饷供应。后又率军镇压苗民起义和白莲教起义。嘉庆元年（1796年）夏卒于军中，谥文靖。著有《百一山房集》等。

清军军事部署为：两路出击，两广总督孙士毅、广西提督许世亨率兵一万出镇南关为正兵，担任主攻；云南提督乌大经率兵八千出白马关为偏师，配合作战。两路皆听孙士毅节制。
乾隆皇帝明确规定了这次用兵的战略目的：官兵直抵黎城，设法将首恶擒获，以期一劳永逸，确保黎氏在安南的统治者地位。

初战告捷
十月，孙士毅、许世亨由谅山分路进军昇龙，广西总兵尚维升、副将庆成率广西兵，广东总兵张朝龙、李化龙率广东兵进军。后黎朝遗臣纷纷响应，宣称清军数十万来吓唬西山军。沿途原本虎视眈眈的西山军不知虚实，虽然经验丰富但在惊恐之下仍然纷纷大败溃散。唯独三江一带的西山军由阮文和率领，据险顽抗。
十一月十三日，尚维升、庆成率广西兵千余人来到寿昌江（今北江，在北江省境内）北岸，阮惠得知后派重兵到寿昌江抵御清军，又分兵屯驻在嘉观。此时西山军退往南岸。浮桥断，皆超筏直上。恰好当时是雾天，西山军草木皆兵无法分辨敌我，自相残杀；尚维昇抓住战机趁机率军渡寿昌江，大破西山军。与此同时，张朝龙也率广东兵破西山军于柱石，此役清军成功渡过寿昌江，夺得了寿昌江之战的胜利。

得知清军入侵之后，镇守昇龙的西山朝大司马吴文楚非常惊恐，遣文官阮衙、陈伯览、武辉瑨等人前往孙士毅营中求和，请求立黎维𜓑为监国，以为缓兵之计，等待富春阮惠的援军。孙士毅拒绝了这个请求。吴文楚召集众将商议，最终接受了吴时任的主张，决定保存西山军的实力，焚毁并抛弃了昇龙城，退往三叠山（位于宁平省和清化省交界处），水陆相通，据险以守。同时召集山南（越南语：Sơn Nam ）、山西、京北（越南语：Kinh Bắc）各地的西山军保卫昇龙。潘文璘对此持异议，因此独自率领一千人来到市球江（越南史料称之为“月德江”，即今越南北部梂江）抵抗。

再破阮军
十五日，清军兵至市球江。根据《清史稿·越南传》的说法，市球江江面宽广而且南岸地势高于北岸，西山军据守南岸，向对岸的清军开炮，致使清军无法渡江，此时阮军据险列炮，守御甚固，清军进攻受阻。孙士毅用计派遣二千人奇兵绕过山的背面潜行至上游二十里处宵济偷袭西山军；另一方面令人为迷惑阮军，清军伐运竹木，于正面搭建浮桥作欲渡之象，建造浮桥以欺骗西山军。西山军中计，十七日于上游渡江的清军奇兵绕到西山军阵地的背后，从山丘上冲下并以乘高大呼下击，向西山军发起猛攻，正面清军乘势抢渡，西山军大败溃散。而《大南列传前编·伪西列传》则称潘文璘率西山军冒寒渡河挑战，清军大破之。潘文璘只身一人逃回，吴文楚隐瞒了这个消息，不让西山军知道，西山军得以顺利地到达三叠山。吴文楚令阮文雪连夜前往富春告急。

三破重防
十九日，清军到达富良江（越南史料称之为“珥河”，即今红河）。富良江乃是通往昇龙（又作黎城）的门户，江之南岸即为安南首都黎城（今河内），此为黎城最后一道屏障。西山军已事先将沿岸的树木全部砍掉，并将江面上的船全部聚集到了南岸，精心布防。
图为安南国战船

孙士毅见西山军守军军容不整，因此乘夜夜幕降临，以到达后艰难觅得几只小舟载兵百余，驶向江心，并夺得战舰一只。许世亨亲自率兵乘舰渡江，复夺得小舟三十余只，更番渡兵，分捣敌营。昏夜中，阮军不辨多寡，惊慌溃逃，清军焚其战舰十余艘。以夺取的三十余船将二千余名士兵分批渡江，并立即对西山军军营发动夜袭。西山军不能辨识来袭清军的数量，大败溃散。

图为乾隆时代清军水师战船