首先，在讨论结局之前先重申几个设定：
1，未来不可改变，自洽性原则成立
2，时间断裂末日之后对于不借助时元的普通人来说时间永远停滞
3，保罗和贝斯都穿越到过时间尽头过，并深信时间断裂末日必然发生。
4，威廉没有时元之力，保罗和主角有时元之力。
5，时元之力的人类和借助时元背心的人都不受时间停滞影响。
6，启动反制对策修复断裂需要大量时元推动

所以根据上面可以推论可能的结局是：
最后在乔伊斯兄弟启动反制对策的时候断裂正好发生，杰克因为全力推动反制对策所以很可能一瞬间失去跳脱时间的能力，和其他人一起陷入了无限停滞状态，而这时候唯一可以行动的是保罗，于是保罗成功拿到了反制对策启动了救生艇协定计划

所以看起来他们使用反制对策阻止了时间断裂，实际上是在停滞的时间里经过了50年救生艇里面的科学家找到了重启时间的办法

反制对策烧毁是因为早就到使用期限了，保罗消失是因为在时间之外过了50年

综上所述，整个游戏可能就是主角在阻止人类唯一的生存希望，最后失败的故事

以上，欢迎来喷

应该是有两次的断裂，第一次是2016年的，第二次不清楚，但一定发生了(2021年时间尽头已经发生)，第一次的断裂确实被主角修复了，但反制对策也因此烧坏了，而且杰克也出现了时远综合征的症状，游戏的结尾杰克表示会想办法救女主，再加上马丁也开始忽悠杰克了，所以很有可能第二次时间尽头就是因为杰克再次启动时光机，意图回到过去拯救女主，时间机器却被马丁做了手脚，时间再次断裂，反制对策之前已经毁坏，所以无法修复断裂，2021年时间的尽头(个人观点)