登场角色:
JUDA Cooperation
早濑浩一

本作主角,14岁,LINE BARREL的因子。3年前因为LINE BARREL的坠落濒临死亡,因为绘美的愿望移植了固有纳米机械存活,成为因子。动画版则是在离校买面包时被偏离轨道的LINE BARREL砸死,在绘美的愿望下成为因子复活。
成为因子之后获得了前所未有的力量,性格也变得好战暴力,表面上是个优等生,实际经常和别人打架。一直憧憬着成为正义的伙伴,在好友矢岛为了自己而死后开始改变自己,想着真正的正义的伙伴努力。
个性冲动,喜欢说口头禅“真实绝妙(nice)的展开!”。喜欢绘美,从LINE BARREL内接触到城崎天儿的过去,得到了天儿的认可。在月面干扰装置破坏作战中失踪,再次登场时穿越到2023年,和伙伴们汇合。之后被泽渡偷袭重伤,最后大脑移植到LINE BARREL的主电脑内。
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城崎绘美

本作女主角,15岁,LINE BARREL的另一个因子。JUDA特务室成员,被石神派去监视浩一,对浩一乱来的行动感到讨厌,随着浩一的改变也逐渐对他改观并喜欢上他,早濑军团的一员。兴趣是园丁。
驾驶LINE BARREL时能够启动B模式,但是在过多使用overload的情况下会严重消耗体力。
在浩一消失后自愿参与战斗,剪短了头发,驾驶加藤久嵩的ARMA月读。
代表台词是“你这个人,最差劲了!”
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森次玲二

JUDA特务室室长,25岁,VARDANT的因子。生来感觉不到疼痛,平常都会穿着特务室的黑色西装和眼镜(战斗时会摘掉),性格沉着冷静,拥有极强的战斗技巧,被誉为JUDA的王牌。
和桐山英治是好友,过去也一度沉迷于力量,教训不良,结果姐姐惨遭杀害且被诬陷为凶手(实际背后是桐山在指使),跌落埋着VARDANT的洞穴成为因子,右眼视力恢复,发色之后也改回黑色。
和桐山的父亲联手,假装背叛JUDA,实际是秘密计划着JUDA收购桐山重工,其本意是希望能将桐山从扭曲的正义中解救出来。之后挂名为桐山重工社长。
JUDA和加藤机关合流后担任二番队队长。
动画版里杀死了石神(实际是石神的要求),之后投奔加藤机关,通过战斗激发浩一和LINE BARREL的能力。
PS:名字应该是取自演员森次晃嗣。
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山下悟

JUDA特务室成员,16岁,性别男,HIND-KIND的因子。身材矮小外貌中性,一开始被浩一误以为比自己年纪要小。对森次抱有崇拜和尊敬的感情。战斗中主要负责远距离支援和情报收集。
动画版里更加强调性别不明的特点。
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远藤静奈
JUDA特务室成员,14岁,泉奈的双胞胎姐姐。平时讲话用着关西口音,起初对缺乏身为因子的自觉的浩一感到反感,之后被浩一搭救后改变态度,一直戴着浩一用领带夹代替的发夹,对浩一有好感。DECEIVE的基本操作。
3年后的剧情里因为泉奈的死感到自责,在道明寺的鼓励下振作起来。
远藤泉奈
JUDA特务室成员,14岁,静奈的双胞胎弟弟。DECEIVE的因子,和姐姐不同的乖巧性格,平时在地下基地帮助牧整备机体。
本身拥有对自己的死亡预知的超能力,在成为DECEIVE的因子后一度被封印,在美海的演唱会里因为DECEIVE预知到美海的杀意带来的后果而暴走,为了阻止DECEIVE而要求美海杀死自己。

九条美海

JUDA特务室成员,16岁。PAINKILLER的因子,是位高中生偶像,因为受到周围人欺负而充满精神压力,在打算自杀时被浩一救下,把浩一视为精神寄托。之后在因为处于精神的生命危机状态,被PAINKILLER承认为因子。
在JUDA和加藤机关合流后失去了社会信用,偶像生涯也不得不终止,在告别演唱会上的杀意引发了DECEIVE的暴走,接受泉奈的要求杀死了泉奈后逃亡。之后在拉拢泽渡时被泽渡杀死。
动画里是和漫画里完全相反的清纯女孩,因为父母的死而被JUDA收养成为因子,喜欢浩一,也吻了浩一。
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中岛宗美

JUDA特务室成员,72岁。TALISMAN的因子。和绘美来自于同一个“世界”,被阿户吕村的村长收养,年轻时离开村子来到东京和妻子薰相识,结婚后发现自己(因为身为因子的原因)无法衰老,之后带着妻子回到村子,独自保护着村子。
一直都希望着能和爱妻一起生老病死,最后在道明寺和浩一的帮助下解开心结,在妻子去世后加入JUDA。因为不习惯西装,改穿石神特制的背后印有JUDA的黑色和服。JUDA和加藤机关合流后担任四番队队长。
动画里是加藤机关二番队队长,和加藤抱有相同的理想,战斗时是个喜欢追着美海打的抖S。
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矢岛英明

JUDA特务室成员,15岁。APPARITION的因子,浩一的青梅竹马,过去一直帮助被欺负的浩一,喜欢理沙子,最后为了保护浩一死去,告诉浩一做自己想要做的事,成为浩一脱胎换骨的关键。
实际上被当时没有因子的APPARITION改造为因子,之后肉体在APPARITION重生(右手没能回收所以装上了运用的机械义肢),苏醒后在石神安排下执行秘密任务,之后和浩一重逢。3年后剧情里和理沙子成为恋人,结局里两人育有一子。
动画里APPARITION被加藤机关回收所以是在加藤机关里苏醒,受加藤司令指示绑架了绘美,在和浩一打了一架后醒悟,加入JUDA,并向理沙子告白。
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石神邦生

JUDA Cooperation社长,JUDA的因子。
平时是个很不正经的大叔,曾经骗浩一进到绘美的房间看到刚出浴室的绘美。很懂得运用人手,暗地里在筹备着自己的计划。
过去是日本海军的中尉,被加藤看中能力加入加藤机关,担任一番队队长,在成为JUDA的因子后脱离加藤机关,开始执行自己和JUDA预测的计划,知道现在的世界是一度被机械天神毁灭后的世界真相的他打算让人类摆脱机械天神的支配。
动画里和森次暗中执行另一个计划,被森次杀死后成为战舰FLAG的控制者。
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绪川结衣

石神的秘书,26岁,经常随石神一同出席重要的场合。动画里面对石神的恶作剧会露出很恐怖的笑容,连石神都对此感到害怕。