一晃，北京南站这个词正式用了三十年了，三十年过的真快，弹指一挥间，当年的事情，现在还在历历在目。
北京南站原称永定门火车站，始建于1897年，后来由马家堡迁到了现在的地方，永定门站拥有三座站台，第三站台没有雨棚，一般的火车停在一二站台，停不开的情况下才往三站台上放，永定门站还有两座天桥，因此是永定门站是一个大型的火车站。
永定门站原先规模并不算很大，起初只停过路车和慢车，后来，北京站由于规模越来越大，把所有除京承市郊以外的慢车，全部迁入永定门火车站，这样一来，永定门火车站的规模就大了起来。永定门拥有到太原，包头，大同，郑州（平顶山）等地的始发车，发往附近的天津，石家庄，木城涧，丰润，滦县的火车还有好几趟，因此，永定门站每天的客流并不小。
1985年调图，把北京到秦皇岛，北京到天津，北京到邯郸，北京到古冶的四趟旅客快车改到了永定门站始发，这样一来，永定门站始发慢车的说话不攻自破。1987年调图，又把石家庄到秦皇岛的列车改到了永定门站，同时增加了北京南到徐州和北京南到佳木斯的列车，这时的永定门站，每天到发的列车多达42对84列，车站的规模超级大。
但是永定门站有着它根本的弱点，就是车站规模比较小，站台比较短，车库也短，因此，所有经过永定门站的列车，编组不长，最多也就是14节，这样的话，很多列车也就不方便了。况且北京南站只有两个有雨棚的站台，三站台基本上就是接短，两个站台有时候也不够用。而且进入北京南站的列车，还要切割正线，京沪线徐州方向进入北京南的列车，要切割京广线的正线才能进入，而京广线进入北京站的列车，要切割京沪线进入北京南站的线路才能进入，而京秦线进入北京南站的列车，要切割到北京的上行线路才能进入，因此，北京南站在线路上并不方便。
1988年1月1日，永定门站改为北京南站。2月，北京南站增加常州到包头的火车。
由于北京南站站台短，先是秦皇岛到石家庄的火车于1991年改到北京站，然后徐州和佳木斯的列车也改为北京站到发。这样一来，北京南站的列车处于减少的趋势是不可避免的。
1993年4月1日，天津到图门的列车延长到北京南，1994年9月1日，天津到长春的列车延长到北京南。
北京南站第二个辉煌是到了2001年，由于京通线的维修，北京南站增加了北京南到赤峰，北京南到通辽，呼和浩特到海拉尔这些原本经过北京北站的列车。到了2003年，由于北京站的维修，哈尔滨到广州和长春到广州的列车也改走北京南站。但时间都不算长。
总的来讲，北京南站有它本身的方便之处，第一来讲，北京南站人相对北京站来讲，要少的多的多，这一点大家可能不太清楚，总以为北京站车多，人多。事实上不是这个样子的，外地人不熟悉的话，总会先去北京站买票，而人们订票的时候，总是先想到北京站。而北京南站的几趟车，总是无人问津，这样一来，北京南站的几趟车客流并不好。第二来讲，在当年硬板票年代，北京南站的车票只在北京南站出售，从不拿到北京市内各大售票点出售，这样一来，很多人当天就能买到北京南站的卧铺车票，而在北京站，看一看郭冬临的小品《有事您说话》就知道是什么情况了。因为北京南站的车是冷门车。第三来讲，北京南站适合短途中转，有的人喜欢北京站，有的人喜欢北京南，甚至有时候可以站内不出站就能转上车，这一点在北京站不太可能，而在北京南站是很现实的。
随着时间的推移，北京南站越发破旧，2006年5月，北京南站拆除重建，新的北京南站成为高铁站，但随着时间的重新推移，新北京南站也略旧狭小，北京南站的前景不太光明。