新建杭州至温州铁路全线线路由杭州枢纽拟建杭州西站引出,沿富阳城区西侧、杭州市规划第二绕城高速公路东侧向南行进,在富阳区高教园设富阳西站,出站后跨302省道、320国道、富春江、在建杭黄铁路、G25长深高速公路后进入金华市域,在浦江县郑宅镇设浦江站;出站后上跨G60沪昆高速公路和103省道,再以线路别形式引入既有义乌站,出站后线路绕过军事区沿沪昆高速和杭长客专中间行进,在溪干村附近上跨杭长客专以及沪昆铁路后折向东南,线路沿义乌市规划疏港快速路并跨越G1512甬金高速公路后至东阳槐堂设站,出站后线路向东南跨越东永高速公路、S26诸永高速公路后沿诸永高速公路东侧走行,相继设磐安、仙居、楠溪江站后至温州市永嘉县,线路跨越楠溪江后以方向别接入甬台温铁路永嘉站。