——潘晓康博士

为提升农大师弟师妹的学习激情，请各位已毕业的学长展开优秀校友的介绍，以激励学弟学妹！现为第一期，希望有人继续！

潘晓康博士

潘晓康博士1985年江西农业大学毕业后分配至中国棉花所栽培室工作。1990-1991在澳大利亚悉尼大学和联邦科学与工业组织（CSIRO）做访问学者，进修作物模拟和棉花计算机管理系统的研究技术。1994年自费出国留学。

　　潘博士1996年在美国伊利诺斯州州立大学获计算生物学硕士，1999在美国伊利诺斯州州立大学获博士学位，2000-2003年在国际著名的冷泉港实验室做功能与比较基因组学的研究，后在爱荷华州州立大学和威斯康星州州立大学做生物信息学方面的博士后研究。主要研究方向是，利用比较基因组学的方法，提高目前海量存在的基因组信息数据的收集、管理、处理、分析、释读能力等。
　　他开发的Synteny Browse软件是GBrowse 软件家族成员之一，用于比较基因组学和进化基因组学的同线性化研究，使蛋白质比对和核酸比对结果具有直观的图形化效果。它是在开放源编码Bioperl模型Bio::Graphics和Bio::DB::GFF的基础上开发而来的，与GBrowse高度兼容。其主要功能是帮助生物学家研究和分析生物的同线性、同源基因以及序列的保守性，尤其在研究基因组复制和进化上具有突出的优势，还可以通过与已注释序列进行比对鉴定基因、调节因子和特殊的基因结构等。该软件具有安装简单，使用灵活，数据输入方便，与模式生物系统兼容性好等特点，广泛应用于：
　　1、鉴定物种间的进化关系
　　物种间的进化关系可以通过物种基因组序列的比对体现出来，具体表现为一系列的相似性区域，即同线性。SynBrowse可以直观地从总体上观察2个物种在整个基因组范围的同线性。
　　2、检测基因的保守性
　　SynBrowse可以对2个具体的基因进行详细的比对，包括基因模式、剪接模式、基因重复等，这对于单个基因进化研究非常重要。
　　3、基因的发现与注释
　　SynBrowse还可以通过与一个已经注释好的基因组序列比对用于基因的鉴定和注释。比如： Medicago 和  Arabidopsis 都是双子叶植物， Arabidopsis 基因组的测序和注释已经完成，使用SynBrowse可以对这2个物种序列进行比对，进而对Medicago基因组序列进行功能推测。