软件工程国家重点实验室
测绘遥感信息工程国家重点实验室
水资源与水电工程科学国家重点实验室
病毒学国家重点实验室(联合)
杂交水稻国家重点实验室(共建)
国家工程技术研究中心
国家多媒体软件工程技术研究中心
国家卫星定位系统工程技术研究中心
国家野外科学观测研究站
湖北梁子湖湖泊生态系统国家野外科学观测研究站
武汉大气遥感国家野外科学观测研究站
教育部人文社会科学重点研究基地
环境法研究所
国际法研究所
社会保障研究中心
信息资源研究中心
经济发展研究中心
中国传统文化研究中心
媒体发展研究中心
教育部重点实验室
地球空间环境与大地测量教育部重点实验室
植物发育生物学教育部重点实验室
口腔生物医学教育部重点实验室
生物医用高分子材料教育部重点实验室
地理信息系统教育部重点实验室
人工微结构教育部重点实验室
水力机械过渡过程教育部重点实验室
生物医学分析化学教育部重点实验室
水工岩石力学教育部重点实验室
组合生物合成与新药发现教育部重点实验室
教育部工程研究中心
有机硅化合物及材料教育部工程研究中心
建筑物检测与加固教育部工程研究中心
植物生物技术与遗传资源利用教育部工程研究中心
雷电防护与接地技术教育部工程研究中心
时空数据智能获取技术与应用教育部工程研究中心
部（局）级研究基地
数学研究所
中国典型培养物保藏中心
中国南极测绘研究中心
地球物理大地测量国家测绘地理信息局重点实验室
极地测绘科学国家测绘地理信息局重点实验室（联合）
数字制图与国土信息应用工程国家测绘地理信息局重点实验室（联合）
精密工程与工业测量国家测绘地理信息局重点实验室（联合）
导航与位置服务国家测绘地理信息局重点实验室（联合）
中国冶金地质总局地球空间信息工程重点实验室
地理空间信息与数字技术国家测绘地理信息局工程技术研究中心（联合）
农业部籼稻杂种优势研究与利用重点实验室
空间信息智能感知国家测绘地理信息局工程技术研究中心（联合）
地理国情监测国家测绘地理信息局重点实验室（联合）
武汉大学中国边界与海洋研究院
武汉大学中国中部发展研究院
武汉大学国家文化创新研究中心
国家文化财政政策研究基地
汉语国际推广教学资源研究与开发基地
中国语情与社会发展研究中心
湖北省重点实验室
核固体物理湖北省重点实验室
多媒体网络通信工程湖北省重点实验室
过敏及免疫相关疾病湖北省重点实验室
化学电源材料与技术湖北省重点实验室
雷达与无线通讯技术湖北省重点实验室
有机高分子光电功能材料湖北省重点实验室
心血管病湖北省重点实验室
生物质资源化学与环境生物技术湖北省重点实验室
流体机械与动力工程装备技术湖北省重点实验室
岩土与结构工程安全湖北省重点实验室
肿瘤生物学行为湖北省重点实验室
消化系统疾病湖北省重点实验室
肠病湖北省重点实验室
水射流理论与新技术湖北省重点实验室
移植医学技术湖北省重点实验室
发育源性疾病湖北省重点实验室
湖北省工程技术研究中心
湖北省氨基酸工程技术研究中心
湖北省光谱与成像仪器工程技术研究中心（联合）
湖北省莲藕工程技术研究中心（联合）
湖北省水体生态工程技术研究中心（联合）
湖北省战略性新兴产业研究中心
湖北省产业技术创新基地
刑事侦察视频图像特征比对分析技术创新基地
大型岩土与结构工程安全控制研究技术创新基地
湖北省自主创新重点基地
分子光电功能材料湖北省高校自主创新重点基地
湖北省人文社会科学研究基地
武汉大学发展研究院
武汉大学人口、资源、环境经济研究中心
武汉大学简帛研究中心
武汉大学科学评价研究中心
武汉大学科技考古研究中心
武汉大学质量发展战略研究院（共建）
中国产学研合作问题研究中心
全球健康研究中心
金融工程与风险管理研究中心
宏观质量管理湖北省协同创新中心
马克思主义理论与中国实践湖北省协同创新中心
湖北语言与智能信息处理研究基地
湖北现代人文资源调查与研究中心
校建平台
动物实验中心
湖北发展问题研究中心
国际问题研究院
财政金融研究中心
国家文化创新研究中心
武汉大学循证与转化医学中心
武汉大学肝胆疾病研究院
武汉大学食品与药品评价研究中心
武汉大学电子显微镜中心
武汉大学A3实验室
武汉大学污淤泥研究中心
武汉大学纳米科学与技术研究中心
武汉大学卫星遥感大气监测国际研究中心
武汉大学生物药研究中心
武汉大学工程检测中心
武汉大学水问题研究中心
教育科学研究院
高科技研究与发展中心