既然是解读就从时间顺序来看好了。前面的剧情很清晰：
捷克斯洛伐克政府计划培育完美的人种，并要做实验，首先是人种培育，于是双胞胎的父亲一个捷克军人奉命与双胞胎的母亲以结婚的名义培育人种，但是父亲爱上了母亲，于是想要带母亲逃离，但是失败了，父亲被杀，母亲被囚禁，但是找到了机会逃亡，并且在逃亡过程中生下了一男一女双胞胎，他们长得很像。在此期间，完美人种实验的总实验师法兰斯爱上了双胞胎的母亲。
母亲和双胞胎一直住在有三只青蛙标志的旅馆中，因为某些原因母亲想要隐瞒自己有两个孩子的事实，于是让男孩女装，并且每次只带一人出去，这样人们就会认为是母女两人。
双胞胎再次成长的期间，法兰斯依然继续实验，不过却是精神教育方面的——在红玫瑰馆的朗读会。政府应当是早就知道了逃出的双胞胎的地址，这个朗读会邀请了双胞胎和其他诸如法兰斯的儿子，异国流浪汉的孩子他们，朗读会的目的是洗脑让他们忘记自己的名字，并以此为支点进而忘记自己的感情。
不断有人失败，有的人是死了，有的人是被驱逐了，但是终有剩下的人，就是双胞胎（因为每次都是一个人去的吧）。政府的人早就知道双胞胎和他们母亲的位置，于是在某一刻决定带走他们，法兰斯因为爱着母亲想要通风报信，但是这也在政府的预料之中。于是政府的人堵住了法兰斯和双胞胎及他们的母亲，并擅自决定在做一个实验，就是要母亲舍弃其中一个孩子。于是母亲做出了选择。

舍弃的一人被带往红玫瑰馆做最后的试验，实验内容是以黑暗和孤独驱散心中最后的感情。最后被带走的人存活了下来，成为了最后的成品。就在政府参与者因此举行庆功宴的时候，法兰斯将所有知情者全部毒死，并让孩子逃回去。
因为一场大火，母亲和剩下来的孩子分开了，当被掳走的孩子回到三只青蛙旅馆的时候，已有那个孩子还在等他。被掳走的孩子对剩下来的孩子讲述了自己的遭遇，被剩下来的孩子因为愧疚和对被掳走的孩子的感同身受而产生了“那个被掳走的人是我，经历这一切的人是我”的错觉，然后他们一同出走。
在出走的过程中，他们遇到了许多好人，但是姐姐安娜却发现那些好人总是会在一阵事件之后离奇死去，她那时还不知道这是弟弟。然后他们决定到东德，在国境线上昏倒的刹那被东德将军发现并救活。
东德将军看出了弟弟约翰的潜质（这个就有点扯了。。），于是将他安排到了东德一个培育完美共产战士的实验场511孤儿院（也是抹杀感情的实验，不过手段是更加暴力的弱肉强食）之中，想要让他继续深造。。结果约翰这个捷克斯洛伐克完美人种实验的成品进入到了东德完美社会主义战士的实验场中，结果是约翰将整个实验场中的人挑拨自相残杀，最后只剩下他和另一个少年。

先看直接证据。

之前想杀约翰是因为她认为被抛弃的是自己，对方没有什么值得原谅的点，现在想明白了自然知道当时被抛弃的是约翰，因为妈妈选择了自己，因此世界上所有人都可以怪约翰，但是安娜不行。
然后间接证据有两个。第一个发生在这件事之前。为什么要约翰女装成安娜，而不是安娜男装成约翰？因为妈妈更爱安娜。第二个发生在这件事之后。为什么恶魔是约翰而不是安娜？因为完成实验的是约翰而不是安娜。
这样一来所有的谜底就都解开了，怪物是约翰，形成怪物的原因是他的经历，怎么样的少儿教育会让人成为怪物呢？1.没有自我2.没有人爱（回应）
作者的中心思想就是：教育需要爱，成长中没有爱的人会成为恶魔。
就是这样。

把约翰装扮成女孩就可以交出安娜了啊...楼主你的逻辑呢...

另一个贴说妈妈抛弃的是安娜。。。

最后一集约翰问天马：这件事我只想问你一个人 妈妈是为了保护我而这么做的吗？还是以为我是安娜？
所以被交出去的是安娜么

实际的怪物是安娜，真正去红玫瑰大屋的是安娜，约翰所做的是把安娜的记忆夺取，还怪物从安娜的记忆取走，所以到最后是哥哥给妹妹一个美好的未来，约翰成功了。