XY老mega:
胡地石-凯那市市集
X喷石-烟突山底部-热焰小径
Y喷石-120公路-天旱焦岩
灾兽石-野生原野区
大嘴娃石-117号道路近绿荫镇交界花圃下面
雷电兽石- 110号路自行车道下
波士可多拉石-卡绿隧道里用碎岩帮助情侣相会后男子赠送
恰雷姆石-送神山坟场顶楼
诅咒娃娃石-送神火山外部山顶
袋龙石-暮水镇
X梦石-未白镇博士研究所旁
Y梦石-联盟门口外
赫拉克罗斯石-127号水路
大甲石-124水路(需要潜水)
巨钳螳螂石-森林里
耿鬼石-对战边疆某屋子里
黑鲁加石-釜炎镇温泉下方
化肥石-流星瀑布中
暴雪王石-123路树果名人之家花园
巨甲石-烟突山山腰-凹凸山道
沙奈朵石-绿荫镇某民屋
电龙石-新紫堇
暴鲤龙石-123路钓鱼屋中跟土狼犬对话后获得
水箭龟石-破浪号甲板上
妙娃花石-119路小屋前的长草
ORAS新mega:
拉帝亚斯石/拉迪欧斯石-得到5个徽章后触发剧情和大吾前往南方小岛自动获得（无需战斗），同时得到mega环，开始可以使用mega进化功能（根据版本）
拉迪欧斯石/拉帝亚斯石-跟老妈对话后获得（根据版本）
迪安西石-把迪安西放在首位进入任意精灵中心触发剧情获得
蜥蜴王石/火鸡石/巨沼怪石-120号道路吊桥上和大吾对话触发变隐龙剧情后，大吾将侦测望远镜送给了主角，并根据主角选择的御三家赠送给主角相应的Mega石
勾魂眼石-琉璃市觉醒祠堂右边
喷火驼石-DELTA章剧情赠送（另一版本为巨牙鲨石？）
巨牙鲨石-战斗边疆前剧情赠送（另一版本为喷火驼石？）
大钢蛇石-某山洞里
巨金怪石-初回配信/二周目挑战联盟打败大吾后获得
暴蝾螈石-DELTA章后到流星瀑布下与NPC对话获得
裂空座Mega进化无需石头，只需学会独门即可，忘掉独门后无法Mega进化
塔布奈石-对战边疆救起了失忆的帅哥刑警后,在小屋再次对话后赠送
艾路雷朵石-秋叶镇跟索蓝斯博士对话后获得
冰鬼护石-浅滩洞穴深处(溯退)
大针蜂石-完成废船剧情后可以捡取
呆河马石-浅滩洞穴中替老人收集好材料后赠送
其余两个御三家石-114路蹲坐的老人，向他买剩下的两颗御三家石头，两颗石均以1500元发售
比雕石-在绿荫镇帮小女孩找寻蘑蘑菇后得到奇妙石，再到得文公司跟社长对话后获得
长耳兔石-紫堇市二楼住宅居帮助西装男后再次对话后获得
七夕青鸟石-带上七夕青鸟到水静市找某男子,给他看七夕青鸟后获得