本部有多处校门，靠近南普陀的大南校门，位于西村的西校门，位于白城的白城校门，还有原化工厂校门。各个校门外皆有公交车站，分别为厦大站、厦大西村站、厦大医院站、厦大白城站。海韵园（教学区）为海韵站，海韵学生公寓有厦大学生公寓站。