当然不是一回事…

两种技能分类 攻击和法术
三种伤害分类 物理、元素、混沌
有攻击能打出元素伤
也有法术能造成物理和混沌伤害
比较入门的分类
深入点还有其他的

法术伤害，是指由施放法术造成伤害，包括各种电、冰、火、混沌等伤害， 元素伤害只特指电、冰、火三种类型的伤害。
元素伤害只是法术伤害中的一部份

1.准确的来说，法术伤害是装备上的一种词缀，并非法术技能造成的伤害叫法术伤害。
2.元素伤害是一种伤害类型，攻击技能和法术技能都能造成元素伤害，元素伤害对应抗性。
3.混沌伤害是和元素伤害并列的，其效果除了可以穿透能量护盾，和元素伤害差不多。
4.法术技能和攻击技能都能造成各种类型的是伤害。一些很特殊的就不多解释了

我觉得完全就是翻译成中文乱了套，楼主说的法术伤害我估计就是Spell，元素伤害就是Elemental (包括Fire火, Cold冰, Lighting电)。这两种伤害没有直接关联，最重要还是看你用的什么技能石头，石头上对伤害类型是有描述的。
举个例子：Discharge（自爆）,石头上的类型描述是Fire, Cold, Lightning, Spell和AoE。也就是说火伤，冰伤，电伤，法术伤害和范围伤害的被动或词缀都可以加成这个技能。注意火电冰三种伤害类型都属于元素伤（elemental），所以元素伤害的被动或词缀同时加成这三种伤害。
再举个例子：Desecrate（我玩的英文不知道中文汉化成啥，应该是亵渎吧，制造尸体那个）,石头上的类型描述是Chaos, Spell, AoE, Duration。也就是说这个技能是混沌伤害，法术伤害，范围伤害和持续技能。法术伤害加成这个技能，但是和原色就一点关系都没了。
所以楼主要是搞不清伤害分类是没有关系的，最重要的是看石头的描述。比较容易出错的就是bruning damage（燃烧伤害）和Degen（正火那种）这两种，其他很容易辨识。

法术是攻击方式 鉴别参照技能石描述
元素是伤害类型 包括冰 火 电 其他伤害类型为物理和混乱