《周刊文春》最新一期却发表了以“指原前男友告白 她曾是超级肉食系”为标题，对指原莉乃过去的恋爱进行了大爆料。
根据杂志的报道称，指原莉乃2008到2009年期间，跟住在东京的杰尼斯型帅哥同学A交往。A是公认的AKB狂热粉丝，每个月都至少花八万日元追星，频繁出现在各种AKB演出会场，为了让偶像记住自己的名字，更是经常给AKB的公司投信。指原莉乃就是因此认识A并且两人没多久就开始交往。
A指出，指原莉乃是标准的肉食系，更大爆料第一次到她家去玩的事情：“指原莉乃明明比我还小一岁，但对那种事情却相当在行的样子。当时抓着我的手从她的大腿往上爱抚还挑逗说‘干嘛一直看地上’‘再过来点嘛’。当时我被什么点燃而爆发了，扑倒了她，和她有了第一次亲吻。”
原则上来说两人约会的场所一般都是指原莉乃的家。A早上五点就要起床，如果学校放假就搭电车花两个小时到指原莉乃居住的中野区公寓。他更透露，，两人第一次发生性关系是在交往四个月后。
2009年秋季A和指原莉乃分手，理由是很不满明明想见却见不到，对此指原莉乃还曾给他发手机邮件指责：“我被你抛弃了！明明床都上了！”另外，《周刊文春》还刊登了指原莉乃被前男友曝光的床上艳照。
宅姐承认 向粉丝谢罪
16日凌晨，在日本放送的广播节目<AKB48的All Night jаpan>中泪如雨下，对此次风囘波表态，并向饭们谢罪:"和这个人曾是朋友的事情属实。真的非常非常对不起"。一同参加节目的总制作人秋元康(56岁)当场作出指原莉乃即日起"移籍"到姐妹团HKT48的决定。
指原一边哭泣着一边解释了此次风囘波的来由:"最开始耳闻到这事情的时候，还搞步清楚是什么状况。看了(周刊文春上的)全文后震惊不已。就整篇文章的内容上来说，虚假，编造的部分非常多。但是，这个人确实曾经是我的朋友"。她同时谢罪道:"难受得吃下的饭都吐了出来，周而复始。。。在全国巡回公演途中囘出现过呼吸(症状)。和妈妈也怎么都没法说。看了饭们在博客上的留言身心都深深地痛苦不已。实在是太对不起了。"
秋元(康)发言表明了自己的看法，点明了指原的"过失"，:"怎么办呢？事实上，这样的事情发生了并糟到了如此的地步啊。如果是路人的话，这事可能不值一提吧？以前发生过的事情被爆料，这是谁都阻止不了的。也就是说(正因为)你做了容易招致误解的事情(才有了今日之祸)。"
他接着切入了正题:"如果无视此事的话，就会变成'是不是宠着指原呢?'这样的状况。实在是非常难办的事情啊"，作为对(指原莉乃)违反了禁止恋爱的铁则的处罚，秋元康作出指原莉乃左迁至西国福冈博多的决定:"为了AKB，不努力是绝对不行的。尽可能快的话。。。明天开始吧。。。(你)移籍到HKT48。"