1.速水玲香诱拐杀人事件
玲香和经纪人安冈被袭击绑架后，歹徒要求金田一赎金送到交易地点。途中却刁难金田一，导致交易失败，而安冈也被歹徒杀害，玲香在晕倒被发现。
2.金田一少年之敢死行
幽禁十二年的少年被“地狱傀儡师”救出，向仇人复仇，并向金田一公然发起挑战。豪华酒店老板被绑架，绑匪同伙却离奇被杀，金田一出现了在案发现场。在“岩窟王”的引导下，刑警目击了金田一刺杀明智警视的过程，金田一逃亡的过程中先后发生多起命案，并被诬陷为凶手不得不继续逃亡，几乎被“地狱傀儡师”逼入绝境。
3.蚁狮穴壕洞杀人事件
金田一受邀前往一个迷宫式建筑“蚁狮穴壕洞”中接受封闭式心理测验，紧接着发生了离奇的杀人案件，连续两位被害人的尸体都突破重重封锁，出现在了另一个封闭区域中……复杂的建筑流。
4.亡灵校舍杀人事件
在废旧校舍的寻宝之旅，一名成员收到署名“亡灵主任”的威胁信后被解决，随后寻宝成员相继离奇遇害，后两起案件的心理暗示诡计很容易能想。
5.香港九龙财宝杀人事件
美雪受邀前往香港给和她外貌一模一样的香港模特杨兰作替身，却被误作是杨兰而遭到绑架。金田一营救美雪时遇见真正的杨兰，随即卷入一系列凶案，被害者和涉案人员都与传说中的九龙城财宝隐隐有关
6.狱门墅杀人事件
夏季，金田一和七濑美雪、佐木龙二两名好友前往狱门补习学校参加集中培训。突然警铃声大作。名为茂吕井的学生手按在警铃上，惨遭毒害。经金田一缜密推理，确定这是一起有有预谋的凶案件。学生一个接一个离奇消失，金田一在最后时刻识破了密室轨迹，和识破高远身份。
7.魔术列车杀人案
警方在幻想魔术团到北海道表演之际收到"地狱傀儡师"的死亡预言，而在途中的火车里，团长真的被谋杀了，尸体更在一转眼之间消失！刚好也在火车上的金田一马上展开调查。到达北海道后，团长的尸体不但离奇地出现在一间客房里，更被人象傀儡一样的绑起。接着，又有团员在表演当中遇害…
8.黑魔术杀人事件
被老朋友委托解开真相的金田一少年来到轻井泽西式住宅「葡萄馆」。透过黑魔术繁盛起来的家族，却陆续以诅咒人偶方式惨死！在假装成诅咒惨剧的背后，居然藏怨恨。而幕后黑手，就是「地狱的傀儡师」高远！
9.绫濑连环杀人事件
故事背景又再次提及到未成年犯罪的因素，但在这个案件的中少年犯不是核心点，而是少年犯重获自由后在地狱傀儡师指导下的“二次犯罪”。