1、原核生物染色体为一个基因连锁群，而真核为两个或以上，当一个有缺陷时另一个可以补充；
2、原核生物染色体不与组蛋白结合，省去的解聚的步骤；
3、原核生物的转录与翻译都在同一区间，而真核是分开的；
4、真核生物基因内有内含子，mRNA会有一个自我剪接的修饰过程，原核生物则不会；
5、真核生物蛋白质的翻译后修饰比原核的更复杂.