在现实中，甚至在一些书刊中，“种”和“底”是两个经常被混为一谈的概念。从珠宝学的角度来看，“种”是指翡翠原石的结构与构造，其内涵是硬玉矿物结晶粒度的大小、硬玉纤维结构的粗细和疏密：“底”则是“种”、“水”、“色”的有机组合和综合体现；观察识别翡翠原石的“种”，注重的是翡翠原石内部构造的、具体的、微观的几何形态指标；认识翡翠原石的“底”，则强调的是有关指标综合形成的一个整体的、宏观的、外在的感觉。显然，“底”与“种”既有联系，又有区别。
　　在有的资料中，将透明度（水）与“底”相混淆，这是不妥的。当然，在众多翡翠原石“底”的名称之中，有的“底”是以透明的特征和透明程度来命名的，但“底”的内涵远远不止是一个透明度指标，“底”和“水”并不是一个概念。这也是容易说得清楚的问题。
　　种”差则“底”差，如结构粗糙的“铁龙生”翡翠原石，其底子就不好，但“种”好“底”却不一定就好，如“瓷底”翡翠原石，有的结构很致密、细腻，但“瓷底”翡翠原石属于中低档的翡翠原石。只有“种”、“水”俱好，才可能有好的底子；只有“种”、“水”、色和翡翠原石的净度俱佳，才会出现很好的底子。