而且这样到第三级他还可以选其他魔契吗

咒剑2级哪有锋刃契约(你描述的有点不清不楚）

你是说他车卡出生自带一把智能魔法武器，并且这武器还是他的宗主？

咒剑的宗主通常可以是智能武器，但咒剑不一定带着，这把武器也可能位于星界，或者插在某个剑座里。
以下是咒剑原文：“大部分咒剑邪术师会模仿这些在堕影冥界中锻造的兵器来塑造自己的利刃。而剩下的选择不使用这些武器，转向链接堕影冥界的暗影魔法网络来施展法术。”也就是说咒剑并不需要持有自己的宗主，甚至可能根本没见过自己的宗主。
如果车卡时1级自带一把智能武器，那dm就要考虑一下平衡问题了，其他pc也要有一定强化，而且要全面强化怪物。
如果PC一定想要用这把智能武器，比较好的处理方法是给咒剑一把宗主自身的复制品，然后咒剑的宗主要求他必须一直使用这把武器，不能用别的。最初最多是一把相同类型的+1武器，然后根据团队等级的进度逐渐解锁这把复制品的能力，直到接近宗主的水平甚至更强。这样也可以严格控制咒剑使用的武器。

有点没太明白楼主的问题。
锋刃契约（刃之魔契）必须在3级获得，从咒剑的巫咒战士特性的描述“如果你在后续选择了刃之魔契特性，你用那个魔契召唤的任何一把契约武器都可以享受到这一增益，且不限武器类型。”可以得出，刃之魔契依旧在3级获得。
所以也不存在3级可以选其他其他魔契的说法。
咒剑只是1级可以通过巫咒战士特性来使用魅力提刀打人。但是要注意：
1：该武器不能具有双手属性，在3级拿到刃之魔契才可以使用双手武器用魅力打人。
2：如果你3级不选择刃之魔契，你将不能使用魔能祈唤里基于“契约武器”才能达成的进阶契约武器，饥渴魔刃，魔能斩击，饮命者等祈唤。因为也有很多术帕是兼职2级咒剑做魔能爆人的。

你可以不让他带啊，宗主和邪术又不是一定要待在一起

你是说他背景嫖了魔法物品和能力？