我也遇到了这个问题,现在已经解决了。
我的解决过程;
1.创建一个总文件夹ENDNOTE,在ENDNOTE这个文件夹下面创建两个文件夹:install和endnote
2.下载好的安装索引压缩包放在文件夹install里面,解压之后双击[EndNote X9 v19.0.0.12062 Setup.msi]安装EndNote X9,安装过程中选择路径时可以选为为endnote文件夹(因为我不喜欢放在C盘
3.安装完成之后,再把汉化的.exe文件复制替换掉endnote文件夹下的.exe文件。
之后就不会出现问题了。