1929年2月23日至26日，南京政府卫生部召开了第一届中央卫生委员会会议。会议讨论了余云岫起草的《废止旧医以扫除医事卫生障碍案》。这一提案除了“一个‘医学外行’次长和一两个参事抱怀疑态度外，其余是满场一致通过”。随后，该提案写入2月25日的会议记录。2月26日，上海《新闻报》率先将此事公诸于众。3月2日，余云岫主编的《社会医报》出版中央卫生委员会特刊，公布“废止中医案”。

“废止中医案”激起了众多中医药界及广大中医药支持者的一片反对声。
著名的汉口叶开泰药号与中医界明确打出了这样的旗帜：“提倡中医，以防文化侵略；提倡中药，以防经济侵略”；公开宣告提倡中医中药之目的是：“促进健康，强种强国，维护民权；职业自由，扫除障碍，张吾民权；发挥天产，推销中药，富裕民生。”
3月11日，上海医界春秋社等8团体发表通电，指责行政手段打压中医界，将其废止中医上升到“摧残国粹学术”的高度。他们一再申明，“中医自有中医诊断之法，勘定病别之类，”并非“巫祝谶纬之道”。
中医界掀起的全国性抗争活动，引起了全社会的关注，也影响着社会安定与政府威信。最终迫使当时国民政府卫生部长薛笃弼现场表态：“对于中西医并无歧视，当本良心主张，对于中西医学，断不有所偏袒。”至此，废止中医案，以失败告终。

为庆祝这次胜利，从1929年起，3月17日被定为“中国国医节”。国家成立了国医馆，武汉市设立了分馆。经此一役叶开泰在中医药界风头一时无俩。
这样，在这次生存抗争中幸存下来的中医界，为了谋求自身之生存，不得不开始对中医理论进行革新和改良，不得不接受中医科学化主张，自觉地进行中医科学化尝试。
1929年的中医存废之争，不是简单的学理讨论，而是中医界为谋求自身生存而进行的殊死抗争。这场论争不局限于中西医学理之是非，而是扩大到思想文化范围，甚至提升到了政治意识形态层面。尽管中医之生存危机并未根本消除，但在中西医两大阵营对峙、冲突与融合与调适过程中，全国中医界空前团结，并逐渐走上了自我革新与科学化之路。

当前，中国经济发展进入新的历史时期，中医药在经济社会发展中的地位和作用愈加重要，已成为独特的卫生资源、潜力巨大的经济资源、具有原创优势的科技资源、优秀的文化资源和重要的生态资源。中医药振兴发展迎来了天时、地利、人和的历史性机遇。中国甚至全球中医药界人士更应团结起来，共谋中医事业辉煌发展，共享杏林金红硕果！