这个嘛,汉献帝本身在汉末统一上有自己的贡献。看待这个问题不能单从个人的得失上来看,要站在当时天下百姓福祉的角度来看。
东汉末年群雄割据军阀混战,民不聊生,作为帝王的汉献帝也深受其害,朝不保夕,带领一帮大臣逃过荒要过饭(董卓死后从长安回迁洛阳,一路逃荒要饭断断续续走了一年多,回到洛阳当时到处残垣断壁无栖身之所,三品以下官员都的出去挖野菜充饥)。所以汉献帝有切身感受,身处乱世连帝王尚且如此更别说百姓了。自己无力肃清宇内当然希望有识之士能站出来解百姓疾苦。这也就是后来和曹操的结合,各取所需。其实历史上的曹操对汉献帝还是十分敬重的,每临战事都要主动向献帝汇报,听取献帝及献帝身边谋士们的意见。
另外一方面,中国以前改朝换代有优待前朝君主的传统。周灭商,纣王自焚,但是封纣王之子为诸侯以继商嗣。秦始皇灭周将周天子从王爵降为公爵,称周公以继周嗣。秦灭六国也将六国公室迁移到咸阳居住并将六国原有王宫也拆到了咸阳供原六国公室居住,这也算是够优待的了。后代,能够善终的末代君主为数不多屈指可数,也就北宋赵匡胤相对仁义一点有待后周家属和南唐后主。
至于杀死前朝君主,应该是始于项羽杀子婴。开了一个坏头,以复仇为目的的报复手段。杀秦王子婴及秦朝官员两千多人,并焚烧咸阳。