游戏主要分为“法庭部分”和“侦探部分”两部分进行，玩家扮演辩护律师交替进行两个部分，引导事件的解决。法庭部分听取证人的证词，玩家作为辩护律师进行“寻问”。寻问中可以直接对证词进行威慑（“ゆさぶる”），也可以提出能够证明证词与事实有矛盾的证物（“つきつける”）。在初代逆转裁判中使用固定点数的5点生命值作为玩家错误辩护惩罚的凭借，选错部分关键选项或提交错误的证物会扣1点生命值，失去全部点数则游戏失败，委托人将获得有罪判决；初代逆转裁判以后固定点数的生命值改为血槽，根据迷题难易程度，扣血量会有所增减，一些重要迷题选错更会导致血槽大幅减少，同时同一天法庭部分中不会回复血槽。玩家在法庭部分可以使用“举证”“威慑”或4代新增的“看穿”、5代新增的“心音”等操作推动剧情发展。除上述操作外，法官或检察官有时也会对案情等内容进行提问，提问的形式多种多样，包括选出正确选项、提示证物、指示图片或影像等。如果辩护律师进行错误辩护，仍会获得相应的惩罚。举证/つきつける 玩家在证词中有矛盾的部分选择“つきつける”，再选择与之矛盾的证物。有时候随着剧情的推进，会要求玩家出示与证人的证词相矛盾的证物。2代和3代中也可以选择人物档案。如果选择正确则故事继续，否则则会受到惩罚并要求重来一次。威慑/ゆさぶる 对证词选择“ゆさぶる”，就能追问出详细的情报。有时不使用“つきつける”仅用威慑也能推进剧情。威慑之后有时会追加新的证词，追问中动摇的证人有时也会作出矛盾的证词，一般来说威慑是不会被惩罚的，但有时也会惩罚，此时审判长会事先给予警告。看穿 自4代中登场。对特定的证词选择手镯，看穿并指出证人撒谎时的“小动作”而推进剧情。看穿时，证人的语速会变得非常慢，更容易暴露出“小动作”。如果错过了，还可以再听一次。即使错误也不会被惩罚。在5代中，由于看穿功能被检察官夕神迅干扰，王泥喜无法在法庭中使用该功能，而“看穿”只使用在调查部分使用，找出证词的破绽，寻找有利情报。[1]心理分析 自5代中登场。通过心音系统可以消除掉证人发言中存在的“噪音”，从而获得新的更加接近真相的证言。通过分析证词中“喜”“怒”“哀”“惊”四种心情来找出证词中的矛盾或通过心理分析找出证词的真相，让证人的证词更准确。侦探部分现场取证收集证据，玩家作为辩护律师可以通过调查犯罪现场或跟其他人对话获取线索和证据。自《逆转裁判2》起新增“精神枷锁”系统，玩家必须解除特定人物的心灵枷锁才可成功获得相关情报，并可使用金属探测器和电波探测器，NDS平台新增科学搜查内容，3DS平台全3D化侦探部分场景。金属探测器和电波探测器1代中作为证物首次登场，但不可以进行实际的操作。在2、3代中均出现。探测器的光标停在有电波或金属反应的地方会变成红色发出“滴滴”的声音（NDS版中会出现CHECK字样），可以调查所在处的物品。不断检查就能找到目标证物。探测器对所有电波或金属的发生源都有反应。精神枷锁2代中首次登场，在2、3、4、5代中均出现。对有心灵枷锁的人出示勾玉，会被问几个问题，玩家需分别出事正确的证物。选错会受到惩罚，血槽归零时会回复极少量并强制退出追问、而不会导致Game Over。解除成功后就可以询问锁的相关情报并回复一半的血槽。此外心灵枷锁在发现时一般并不能马上用手头上的证物解除，一般都必须在其他场景深入调查获得新证物和情报之后返回才能解除。科学搜查利用NDS的触摸屏，可以进行相关检测。3D证物首次出现在《复苏的逆转》最后一话。利用NDS的触摸屏，证物采用3D表现形式，可以对XY轴放大缩小，用手写笔从不同角度调查证物的可疑之处。鲁米诺试剂首次出现在《复苏的逆转》最后一话。将鲁米诺试剂喷洒在证物中，透过特别的红色镜片，可以观察到有血液反应的地方。指纹检验首次出现在《复苏的逆转》最后一话。用手写笔在有可能有指纹的地方撒上采集粉，通过向麦克风吹气吹走多余的采集粉提取指纹，然后对比与指纹一致的人物。足迹检验首次出现在4代第二话。点击脚印（鞋印）涂抹石膏，用吹风机烘干后刷上墨提取脚印。最后进行脚印对比。毒物检测首次出现在4代第四话。与血液检测类似，这次是对剧毒阿托奎宁产生反应。X线解析装置首次出现在4代第四话。使用X射线对物体进行透视调查，可观察物体内部断层，利用这点可以调查信封里面和油画的底稿。
