刚用为知笔记的时候，感觉到多级目录与标签似乎要矛盾很多。首先，为知笔记的目录和标签同样是可以无限级扩展的，感到作用有些重叠。我早期认为，多级目录和标签是矛盾的，印象笔记等只有2级目录（笔记本组→笔记本）的笔记类应用才需要标签补充多级目录缺失的问题。但是，我忽略了一个细节，那就是目录只能有一个，标签却可以有N个。
有些时候，一些笔记适合用两种目录来管理，这时就是多级目录的一个弊端。笔记只可以有一个目录。有人会说，直接用为知笔记的复制笔记功能不就得了。这是一个解决办法，但是绝不是最佳的。这样做的话，搜索就会搜出一大堆毫不相关的东西；而你想要的，却被埋没在大量的无用信息里。
碰到这种情况，你就可以给这些笔记打上标签。但我不建议你“未雨绸缪”的打上标签。而是在有一定数量的笔记有大量相同性时，再打上标签，目录也是如此。
两级目录笔记类软件最著名的莫过于印象笔记，毕竟，曾经身价十亿。虽然近期有一定的衰退迹象，但还不至于倒闭。
印象笔记是大而广的便签盒，最好在目录上尽可能的粗放，再用标签进行管理。是一个网状结构。
打个比方，王小明住在XX市的XX小区中的XX楼的XX单元的XX门牌号。用印象笔记就得贴上XX市的XX小区中的XX楼的XX单元的XX门牌号的便签。而为知，则直接是用更直接的多级目录解决。
在知乎上有很多人争论到底是用树状管理，还是用网状管理。其实这些争论都是毫无意义的。树状管理有树状管理的优势，网状管理也有自己的优势。应该互相借鉴融合才是。与其在知乎花大量时间上争论到底用树状管理还是用网状管理，倒不如抽出一些时间认真的实践树状管理和网状管理。在体会的同时，你会意识到自己最适合用哪种管理方式来管理你的知识。
我个人认为，树状管理是一种很有规律性的管理方式。很多图书馆都采用这种管理方式。但是不适合那些对目录管理的比较松散或分得过细的人。分得过松的人会出现这样情况在科技放一大堆关于互联网，虚拟现实，笔记类软件..........最后根本找不到自己需要的信息。虽然为知笔记的搜索功能足够用，但是也不一定能百分百的搜索到你要的信息。并且，为知笔记的搜索功能是不会像人类一样学习的。比如，你要搜索有关为知笔记的信息，为知的前身叫网文快捕。搜索功能只能搜索到含有为知笔记的内容。
第二是分的过细的人。他们可能这样分：在科技 互联网 软件 笔记类软件 为知笔记 为知笔记技巧等。但是如果碰见又讲为知笔记的发展史又讲为知技巧的笔记就无法分类了。因此，使用树状目录尽量不要超过3级。对于那些大目录中比较碎且规整的笔记可以使用标签进行管理。比如我管理一个大的为知笔记目录时，我可以给一篇笔记贴上使用技巧和用户案例这两个标签。我们就可以知道：这篇文章是介绍为知笔记用户的使用案例，并且分享了自己使用的干货。我使用树状目录归类比较大的资料，用标签管理目录中零碎的笔记。
我们可以发现，树状目录应该是和标签系统互补的；而不是在知乎上争论的那样，如果用标签就不能用树状目录，用树状目录就不能用标签。我们应该好好利用为知给我们的提供功能，并用为知笔记使自己高效。